TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g26970
TIGR annotation:aconitate hydratase, cytoplasmic, putative / citrate hydro-lyase/aconitase, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2434.9   80.28
 2546.8 
 2590.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1785.4   18.91
 1777.1  
 1749.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  2041.2   13.7
 2030.6 
 2014 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1629.6   143.04
 1417 
 1357.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1067.7   40.22
 1122 
 1146.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1340.7   52.08
 1336.3 
 1428.6 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1868.6   83.74
 1772.7 
 1701.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  2734.3   77.11
 2878.9 
 2853 
 1.03 Root (ATGE_95)  3246.9   161.43
 3262.7 
 3534.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1407.2   31.98
 1357.9 
 1417.9 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1293.1   34.43
 1259.3 
 1328.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2009.1   14.12
 2031.9 
 2006.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2429.2   26.66
 2426.5 
 2474 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1094.3   74.32
 1216.5 
 1082.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1103.9   3.87
 1111.7 
 1108.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  1137.1   36.91
 1071.1 
 1132.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  2914.9   154.38
 3047.3 
 2739.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  2772.8   50.55
 2673.6 
 2740.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  3191.7   101.58
 3113.4 
 3314.9 
 3.20 Roots (ATGE_9)  2118.3   11.35
 2096.5 
 2112.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  2071.9   107.4
 1905.2 
 1871.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1901.3   51.16
 1978.6 
 1881.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1947.2   14.01
 1974.5 
 1955.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1049.3   21.03
 1068.7 
 1091.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1942.2   94.52
 1825.8 
 2013 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2049.3   104.95
 2203.4 
 2002.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2071.2   58.19
 2041.3 
 2153.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1811.8   37.47
 1857.6 
 1886.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1667.6   65.06
 1792.7 
 1699.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1372.2   60.23
 1474.2 
 1367.7 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1630.7   65.35
 1507 
 1532.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1612.3   75.38
 1548.2 
 1462.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1167.7   44.12
 1174.8 
 1247.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1328.8   25.69
 1377.9 
 1366.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1738.8   57.46
 1658 
 1769.1 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2422.9   79.65
 2578.7 
 2529.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1568.3   25.42
 1549.3 
 1599.6 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  3499.3   100.93
 3423 
 3299.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1100.8   26.48
 1114.3 
 1151.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1740.3   70.67
 1671.5 
 1812.8 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1220.3   60.98
 1316.7 
 1203.7 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  3925.3   351.18
 4522.6 
 3904 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  2222.9   48.48
 2192.3 
 2127.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1930.8   64.03
 1893.1 
 1805.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1214.5   19.78
 1186 
 1176.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1317.5   13.72
 1309.2 
 1290.7 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1721.2   148.85
 1502.1 
 1437.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  2243.7   210.52
 2644.5 
 2332.5 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  4167.2   269.42
 3769.8 
 3653.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  876.5   5.08
 870.9 
 881 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1587.4   47.4
 1559.1 
 1494.9 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1145.1   16.57
 1175.7 
 1171.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1047.8   9.61
 1059.7 
 1066.9 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  761.9   11.46
 739.8 
 745.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  662.6   17.48
 642.7 
 627.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  524.1   27.1
 576 
 536.7 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  522.5   15.71
 493.4 
 518.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  541.5   26.12
 517.8 
 489.3 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays