TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g27320
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1033.3   34.47
 1036.2 
 1094.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  788.5   29.16
 846.6  
 813.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  865.8   27.96
 915.3 
 868 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  703.5   54.26
 810.5 
 741.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  731.6   24.32
 733.8 
 774.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  810   22.59
 832.1 
 855.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  520.1   34.2
 586 
 537.3 
 1.03 Root (ATGE_94)  1199.1   71.59
 1216.7 
 1330.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  1246.1   77.13
 1397.7 
 1346.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  684   20.36
 691.9 
 653.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  739.7   12.96
 736.9 
 760.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  938.5   47.21
 874.2 
 846.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  795.5   21.01
 764.5 
 804.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  677.2   6.31
 664.7 
 669.5 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  673.1   22.01
 709.2 
 713 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  742.2   20.87
 715 
 701.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  1210.4   25.15
 1161.8 
 1174.7 
 3.20 Root (ATGE_98)  1168.8   59.37
 1088.1 
 1203.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  1167   33.7
 1193.4 
 1126.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1126.4   43.72
 1062.7 
 1042.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  752.6   10.28
 750.4 
 769.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  627.3   18.96
 659 
 661.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  662.1   14.87
 669.6 
 640.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  782.5   13.55
 794.2 
 767.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  903.3   22.99
 878.9 
 857.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  823.6   30.65
 763 
 801.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  705.8   4.39
 713.7 
 706.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  682   8.14
 667.2 
 668.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  611.6   15.84
 596.2 
 627.8 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  563   15.81
 585 
 593.7 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  866   52.95
 922.6 
 816.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  869   15.27
 899.3 
 887.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  693.8   22.58
 691.6 
 653.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  706.2   47.11
 612.6 
 650 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  595.9   91.77
 773.5 
 644.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  863.8   33.74
 820.2 
 797.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  700.1   2.45
 704.9 
 701.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1162.3   72.67
 1125.3 
 1022 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  588.3   28.58
 632 
 578.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  947.6   35.4
 885.6 
 946.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  785.7   3.95
 791 
 793.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1168   29.14
 1212 
 1156.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1195.5   21.9
 1229.1 
 1236.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1161.3   64.58
 1267.1 
 1278.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  651.6   12.06
 675.1 
 658.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  766.1   21.94
 724.7 
 758.1 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  417.5   11.86
 398.6 
 420.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  853.2   43.27
 802.4 
 888.4 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1043.2   33.9
 1078.4 
 1010.6 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  915.1   16.06
 945.7 
 921.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1226.9   4.86
 1232.6 
 1236.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  864.3   40.14
 879.5 
 940.1 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  952.1   66.54
 1013.5 
 1085.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  807.1   25.57
 842.3 
 856.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  900.8   3.68
 907.8 
 906.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  587.8   23.23
 619.2 
 633.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  717.7   27.43
 685 
 739.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  620.5   24.68
 577.9 
 577.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays