TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g30870
TIGR annotation:repair endonuclease family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  126.9   14.18
 105.6 
 99.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  88.2   2.56
 93.2  
 89.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  60.8   2.32
 59.1 
 63.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  57.9   1.69
 54.8 
 57.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  85.9   0.3
 85.4 
 85.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  121.6   2.78
 117.3 
 122.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  69.5   2.59
 64.4 
 67.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  86.5   4.58
 86.9 
 94.6 
 1.03 Root (ATGE_95)  93.4   6.14
 82.9 
 82.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  69.3   5.31
 73.9 
 63.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  71.7   2.82
 70 
 66.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  65.2   1.83
 62.2 
 65.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  63.4   9.87
 79.7 
 61.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  82.2   0.5
 82 
 82.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  152.6   6.57
 156.8 
 143.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  90.3   4.9
 85.8 
 80.5 
 3.20 Root (ATGE_93)  75.2   2.87
 69.7 
 73.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  99.7   18.09
 94.7 
 66.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  83.5   3.15
 85.6 
 89.7 
 3.20 Roots (ATGE_9)  105.2   2.96
 109.9 
 104.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  66.7   5.79
 58.8 
 70 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  54.6   1.62
 55.4 
 52.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  56.1   0.57
 55 
 55.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  58.9   3.8
 65.9 
 65.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  77.4   1.73
 74 
 75.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  63.7   5
 59.9 
 69.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  70.8   6.83
 58.2 
 69 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  50.8   5.39
 61.6 
 56.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  56.3   7.39
 69.7 
 57.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  70.2   2.67
 65.6 
 65.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  62.3   1.32
 64.3 
 61.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  66.5   1.97
 67.1 
 70.2 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  164.3   4.33
 156.1 
 157.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  149.9   2.81
 154.6 
 149.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  94.3   3.1
 92.6 
 88.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  72.3   9.87
 91.4 
 77.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  85.6   2.3
 86.2 
 89.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  89.2   10.65
 93.7 
 109.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  122.8   12.14
 125.1 
 144.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  81.2   1.58
 79.4 
 82.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  69.5   1.46
 66.7 
 67.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  64.5   9.2
 80.9 
 65.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  61   5.44
 64 
 71.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  69.3   3.27
 63.5 
 63.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  98.5   2.56
 101 
 103.6 
 6.00 Flower (ATGE_92)  121.9   2.73
 119.9 
 125.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  101   24.25
 149.3 
 121.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  61.6   8.51
 77.7 
 64.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  94.8   0.84
 93.4 
 94.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  90.8   3.52
 88 
 94.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  61.9   6.37
 64.8 
 74.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  89.9   4.74
 98.2 
 90 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  98   8.37
 95 
 82.2 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  99.5   0.85
 97.9 
 98.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  94.3   1.31
 93.3 
 95.9 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  94.7   5.33
 91 
 101.5 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  90.1   9.85
 71.7 
 87 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  117.6   16.73
 102.9 
 84.3 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays