TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g32940
TIGR annotation:vacuolar processing enzyme gamma / gamma-VPE
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  788.1   25.53
 740.5 
 748.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1339.7   1.41
 1342.4  
 1340.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  2680.8   28.7
 2680.3 
 2630.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  596.6   26.77
 544.7 
 559.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  509.2   20.05
 545.1 
 511.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  502.3   22.76
 530.3 
 547.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  765.4   27.96
 709.9 
 743.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  2723.3   237.19
 2522.6 
 2250.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  2039.4   108.32
 2220.7 
 2232.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  420.7   15.03
 425.9 
 449 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  970.9   5.21
 980.1 
 979.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1878.2   81.86
 1843.3 
 1722.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2567.4   5.27
 2574.8 
 2577.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  733   61.34
 828.4 
 713.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  546.7   9.62
 538.3 
 527.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  609.1   3.09
 604.1 
 609.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  1858.7   67.05
 1984.7 
 1881.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  3943   131.56
 4004.7 
 4195.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  3990.2   70.37
 4065 
 3924.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1029.8   15.55
 1043.8 
 1060.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1025.4   4.98
 1028.9 
 1019.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1609.8   8.77
 1592.7 
 1604.5 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1212.4   21.2
 1171.5 
 1182.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1522.7   23.05
 1514.2 
 1557.7 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  8214.1   106.68
 8425 
 8347.9 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  3403.1   16.23
 3371 
 3383.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1620.7   20.1
 1613.6 
 1651.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  948.2   8.39
 962.9 
 948.5 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  762.8   16.67
 745.2 
 729.4 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  621.1   25.09
 670.5 
 638.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  3903.4   89.32
 3859.5 
 4031.4 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  5575.9   207.7
 5191 
 5248 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  810.5   8.19
 821.3 
 826.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  921.8   39.45
 988.6 
 991.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  954.2   27.67
 1009.5 
 982.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  3148.2   138.46
 2941.5 
 3204.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  664.2   25.31
 633.3 
 614.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1595.3   15.35
 1569.4 
 1596.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  728.3   19.2
 739.5 
 765.7 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  5576.8   74.4
 5692.4 
 5553.4 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1014   36.19
 945.4 
 999.8 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  9468   273.97
 8990.1 
 8996.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  11500.2   687.96
 10124.7 
 10841.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  6747.6   70.74
 6837.5 
 6887.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1336   34.85
 1302.2 
 1371.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1276.3   15.74
 1246.3 
 1253.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1245.4   274.6
 1787.2 
 1594.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  12577.3   104.75
 12704.3 
 12496.5 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  16022.3   230.25
 15645.4 
 16063 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1691.2   33.26
 1716.1 
 1650.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  12149.5   74.28
 12117.3 
 12007.8 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  5193.5   71.11
 5309.4 
 5322.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  5657.9   438.83
 5098.2 
 4792.5 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2962.6   132
 3182.1 
 3199.4 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  3184.8   120.25
 3425.3 
 3307.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  3364.6   335.19
 4002 
 3503.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  4445.3   106.54
 4594.1 
 4387.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  4243.6   45.54
 4292.1 
 4334.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays