TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g34190
TIGR annotation:stress enhanced protein 1 (SEP1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS4

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  323.7   8.63
 320.1 
 336.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1633   37.99
 1606  
 1557.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  6247.3   179.59
 5920 
 6211.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  5570   20.24
 5536.8 
 5573.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  5258.3   207.34
 5580.1 
 5645.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  3250   116.7
 3046.1 
 3246.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  5021.2   259.44
 5210.3 
 5534.2 
 1.03 Root (ATGE_94)  681   12.77
 668.9 
 694.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  599.6   32.04
 535.6 
 565.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  6170.1   178.04
 5896.9 
 5835.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  5686.9   234.24
 6146.9 
 5994 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  5099.4   137.27
 5247.4 
 5373.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  4981.9   154.28
 5095.6 
 5287.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  5731.6   30.75
 5788.8 
 5740.6 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2153.1   146.75
 2379.8 
 2105 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  5449   154.67
 5223.2 
 5153 
 3.20 Root (ATGE_93)  613   29.33
 554.5 
 587.6 
 3.20 Root (ATGE_98)  783.3   38.72
 709.6 
 767.1 
 3.20 Root (ATGE_99)  601   9.46
 619.7 
 607.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  330   6.74
 317.4 
 319.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  3622.1   721.64
 4915 
 4824 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  5725.3   109.8
 5918.8 
 5732.1 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  6328.3   266.42
 6103.3 
 5797.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  5196   40.94
 5157.9 
 5114.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  5224.9   30.12
 5282 
 5270.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  5807   47.02
 5812.2 
 5891 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  6328.2   118
 6134.7 
 6348.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  6365.3   83.35
 6499.6 
 6517.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  6155.7   128.19
 6370.8 
 6142.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  6255.5   72.61
 6367.8 
 6391.4 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  4888.5   99.3
 4763.6 
 4692.4 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  4680   275.32
 4129.8 
 4424.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  4608.2   161.48
 4864.6 
 4906.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  5717.5   447.96
 4971.3 
 5773.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  5560.9   338.88
 5175.4 
 4885.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  7067.3   197.96
 7030.9 
 7390.5 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2513.5   147.72
 2424.9 
 2225.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  957.8   37.91
 921.5 
 882 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  2164.7   34.95
 2095.4 
 2138.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  3400.4   27.1
 3451.5 
 3441.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  5329.9   541.95
 6412 
 5925.1 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  5312.1   417.02
 5129.5 
 4516 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  2414.1   120.21
 2179.5 
 2342.4 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1793   16.58
 1818 
 1786.6 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  4191.2   218.88
 3801.8 
 3823.3 
 6.00 Flower (ATGE_92)  4257.4   200.49
 4038.9 
 4439.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  482.2   30.73
 515.4 
 454 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  4446.3   729.21
 3239.1 
 4551.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2005.8   85.98
 2177 
 2105.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  5112.8   234.53
 4645.8 
 4917.5 
 6.50 Stem (ATGE_27)  2521.1   156.19
 2269.8 
 2556.1 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  3607.2   176.34
 3313.6 
 3629.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  3131.3   180.54
 2931.7 
 2771 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1177.2   64.99
 1049.1 
 1132.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  828.8   51.04
 854 
 927.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  393.4   31.68
 446.6 
 390.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  331.6   11.96
 344 
 320.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  319.2   23.28
 304.8 
 273.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays