TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g37270
TIGR annotation:cadmium/zinc-transporting ATPase, putative (HMA1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  417.9   0.87
 419.2 
 419.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  664.3   27.14
 718.2  
 697 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1086.8   68.67
 1223.4 
 1167.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  919.4   32.59
 984.3 
 946.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  695.4   27.07
 641.5 
 672.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  532.3   14.79
 517.3 
 546.9 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1303.5   68.71
 1211.7 
 1169 
 1.03 Root (ATGE_94)  586.3   11.69
 586.6 
 606.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  584   28.14
 636.4 
 627.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  872.7   35.66
 812.6 
 809.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  880.5   22.69
 911.3 
 924.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1002.2   19.38
 974.9 
 964.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1013.8   14.83
 1025.4 
 1043.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  814.9   48.04
 891.7 
 803.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  498.4   15.89
 514.2 
 482.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  750.5   27.76
 695 
 723.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  530.3   36.77
 463.2 
 522.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  539.1   19.46
 507.9 
 543.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  536.1   12.35
 540.3 
 559.2 
 3.20 Roots (ATGE_9)  378.3   17.32
 393.7 
 359.1 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  945.1   33.25
 879 
 906 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1159.5   60.86
 1130.5 
 1042.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1128.8   18.81
 1157.5 
 1122.1 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  881.2   22.54
 895.5 
 925.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1012   75.37
 977 
 1121.4 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1113.1   35.75
 1184.4 
 1152.6 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1111.5   35.05
 1178.5 
 1163 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1033.2   31.73
 1068.3 
 1096.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  966   27
 943.8 
 912.3 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  815.3   40.46
 894 
 871 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  968.7   4.8
 976.7 
 968.1 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1002.2   22.19
 994 
 960.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  719.9   10.68
 698.6 
 707.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  931.2   51
 945 
 850.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  723.9   57.98
 837.1 
 758.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1375.4   21.9
 1333.9 
 1366.7 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  704   11.35
 685.6 
 683.3 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  712.3   7.74
 703 
 696.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  608.3   21.22
 650.2 
 623.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  907.8   43.67
 824.3 
 888.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  944.8   39.78
 934.5 
 871.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1434.8   104.34
 1637.7 
 1494.1 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  923.4   35.16
 949.4 
 993 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  765   18.98
 777.6 
 740.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  752.9   33.56
 719 
 685.8 
 6.00 Flower (ATGE_92)  655.3   19.93
 691.6 
 687.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  405.1   35.83
 346.7 
 340 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1415.8   116.39
 1272.8 
 1503.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1234.1   68.75
 1215.8 
 1107 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  746.1   16.12
 717.8 
 745.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1003.5   56.53
 1025.7 
 918.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  865   14.47
 890.1 
 889.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  919.9   30.28
 862.1 
 906.9 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  702.9   15.65
 671.7 
 688.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  557.3   20.98
 533.2 
 575 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  453   9.64
 446.3 
 465.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  487.1   37.92
 418.8 
 481.4 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  454.7   55.51
 444.4 
 353.8 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays