TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At4g37930
TIGR annotation:glycine hydroxymethyltransferase / serine hydroxymethyltransferase / serine/threonine aldolase (SHM1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  329.6   9.51
 319.3 
 310.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  2541.1   140.14
 2283.4  
 2316.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  9541.5   167.87
 9205.8 
 9375.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  7344   49.82
 7305 
 7403.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  5091   57.36
 5204.2 
 5131.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  2164.1   82.89
 2259.8 
 2094.7 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  8497.4   186.42
 8370.3 
 8737.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  586.8   12.38
 562.8 
 579.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  553.2   35.51
 561.3 
 618.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  6271.8   181.2
 5943.2 
 6239.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  6581.3   153.94
 6484.2 
 6279.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  8394.3   238.67
 8718.2 
 8252.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  8019.9   136.31
 8230.8 
 7975.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  6041.1   208.93
 6022.5 
 5670.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  1450.8   76.66
 1463.6 
 1324.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  5144.9   204.3
 4737.4 
 4915 
 3.20 Root (ATGE_93)  567.5   13.83
 557 
 540.1 
 3.20 Root (ATGE_98)  578.7   4.15
 577.7 
 585.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  581.1   22.6
 618.5 
 577.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  253.3   6.01
 259 
 265.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  7334.5   191.85
 7082.2 
 7458.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  8893.6   311.8
 9052.7 
 9495.3 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  9203.6   156.02
 8909.2 
 8966.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  7269.8   160.08
 7244.2 
 6980.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  9087.9   262.9
 9595.8 
 9224.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  9380.4   175.52
 9657 
 9331.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  9299.2   284.81
 8994.1 
 9563.2 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  9130.3   201.31
 8843 
 8742.4 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  7965.6   143.82
 7981.9 
 8222.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  7009.3   164.36
 7037.4 
 7307 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  7700.6   326.27
 8194.7 
 8316.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  8466.2   371.84
 7742.6 
 7955.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  3954   195.37
 4283.2 
 4300.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  6574   132.07
 6807 
 6798.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  6206.7   288.63
 5633.5 
 5860.8 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  9544.6   303.36
 9212.8 
 9818.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1765.4   32.62
 1775.8 
 1714.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1294.9   23.5
 1330.9 
 1286.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1683.5   31.12
 1643.3 
 1704.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  4871   275.99
 5419.4 
 5091 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  6807.8   158.51
 7110.3 
 6877.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  8277.4   515.14
 8874.5 
 7848.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  3913.6   199.46
 3944.4 
 3584.6 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  2846.3   138.18
 3110.2 
 3049.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  3451.2   97.74
 3255.8 
 3357.4 
 6.00 Flower (ATGE_92)  4309.5   129.28
 4559.1 
 4492.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1834.9   46.7
 1825.6 
 1749.8 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  8567.4   107.12
 8748.2 
 8558.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2664.9   106.24
 2479.6 
 2662.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  4933.2   222.53
 5165.4 
 4720.5 
 6.50 Stem (ATGE_27)  7960.6   148.59
 7764 
 8055.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  6775.8   406.72
 5977.6 
 6241.1 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  5554.8   458.91
 5109 
 4637.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  667.2   17.83
 631.6 
 651.9 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  473.7   6.69
 485.8 
 474.7 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  100.5   14.18
 127.5 
 121.6 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  94.3   9.38
 91.4 
 108.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  91.9   6.07
 87.2 
 99.3 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays