TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g01490
TIGR annotation:cation exchanger, putative (CAX4)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  276.7   19.26
 259 
 297.5 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  197.6   8.74
 209.5  
 214.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  272.3   11.25
 294.7 
 285.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  266.9   14.26
 292.1 
 291.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  229   13.39
 254.5 
 234.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  230.7   3.97
 226.2 
 222.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  191.1   21.43
 220.7 
 232.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  375.2   28.19
 392.8 
 430.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  449.7   6.02
 449.8 
 439.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  309.5   23.93
 287.4 
 261.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  284.8   17.4
 266.4 
 301.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  374.5   56.57
 288.1 
 268 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  300   12.3
 295 
 276.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  295.1   53.26
 207.8 
 304.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  142.6   17.16
 148.5 
 174.9 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  324.3   60.3
 284.5 
 205.8 
 3.20 Root (ATGE_93)  428.4   22.62
 389 
 389.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  354.1   41.81
 361.1 
 429.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  415.4   25.48
 368.4 
 374.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  258.4   5.4
 251.3 
 247.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  240.4   25.97
 188.5 
 212.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  236   7.5
 243.4 
 251 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  254.8   6.2
 244 
 244.1 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  284.7   14.18
 286.7 
 310.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  229.9   36.14
 208.8 
 279.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  232.2   30.79
 293.4 
 268.6 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  279   13.18
 304.7 
 297 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  222.9   19.77
 256.5 
 257.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  263.7   30.66
 324.8 
 289.2 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  280.1   7.69
 285.8 
 270.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  260.6   24.87
 309.6 
 292.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  259   20.84
 283.7 
 300.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  206.7   11.25
 211.2 
 189.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  248   37.9
 172.2 
 210 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  254.1   28.74
 213.7 
 198.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  256.6   9.81
 249 
 237.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  206.3   45.6
 234.5 
 295.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  278.8   4.65
 286 
 277.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  223   8.92
 206.1 
 209.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  200.8   22.94
 220.9 
 246.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  318.3   23.19
 274.3 
 308.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  248.4   23.21
 291.2 
 285.4 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  281.2   49.92
 257.9 
 185.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  305.5   19.82
 324.7 
 285.1 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  198.7   12.21
 219.7 
 220.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  207.9   13.79
 181.7 
 202.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  663.8   100.06
 858 
 802.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  241.2   10.59
 262.3 
 250.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  251.7   17.68
 272.2 
 237 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  243.9   10.37
 223.8 
 229.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  202.3   25.23
 251.8 
 218.4 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  189.8   6.18
 201.4 
 191.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  220.1   7.02
 210.9 
 224.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  250.9   15.01
 227.8 
 222.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  274.5   17.66
 254 
 239.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  342.1   14.4
 330.1 
 313.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  469.5   67.55
 334.5 
 398.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  430.2   53.3
 446.1 
 346.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays