TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g12170
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  513.4   9.02
 495.8 
 501.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  793.1   11.53
 774.9  
 796.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  995.6   29.49
 969.9 
 936.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  504.8   10.2
 494.9 
 484.4 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  381.1   11.13
 364.1 
 360.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  389.8   18.58
 390.8 
 422.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  664.3   31.91
 694.9 
 631.1 
 1.03 Root (ATGE_94)  761.4   9.51
 744.6 
 760.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  870.5   47.4
 922.5 
 965.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  430.3   8.07
 421.2 
 414.2 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  482.9   20.71
 484.4 
 519.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  849.8   32.68
 914.6 
 874.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1152.1   35.84
 1110.2 
 1080.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  323.6   29.45
 346.8 
 382.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  239.5   11.28
 258.2 
 259.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  298   42.9
 383.7 
 344.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  704.8   21.71
 696.8 
 663.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  597.8   23.45
 552.2 
 584.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  643.5   36.03
 708.5 
 649.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  459.1   12.25
 449.5 
 434.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  739.9   29.88
 681.3 
 700.6 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  598.8   17.76
 589 
 564.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  603.7   14.43
 607.3 
 630.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  571.4   20.9
 610.7 
 578.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  914.6   29.14
 962.9 
 966.9 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  749.4   22.37
 715.3 
 707.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  631   12.14
 653.5 
 634.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  562.7   11.91
 568.9 
 585.7 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  524.5   25.68
 473.2 
 500 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  398   9.31
 415.4 
 401 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  675.9   22.57
 636.2 
 674.6 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  829.6   44.21
 763.6 
 745.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  266.8   26.44
 303 
 251.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  382.9   37.05
 343.7 
 308.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  400.9   24.86
 417.5 
 368.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  734.9   11.02
 729 
 713.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  275.5   9.14
 282.4 
 293.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  328.8   38.33
 355.3 
 279.7 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  402.8   7.77
 387.5 
 397.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  622.4   25.54
 604.4 
 572 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  581.4   18.56
 558.5 
 544.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  953.4   20.92
 915 
 920 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  906.4   18.29
 901.2 
 935.2 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  651.2   21.91
 694.9 
 674.1 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  378.2   23.13
 424.1 
 395.8 
 6.00 Flower (ATGE_92)  358.1   11.52
 341.9 
 364.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  236.5   11.13
 255.8 
 236.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1144.9   28.61
 1121.3 
 1178.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1273.3   91.1
 1287.5 
 1123.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  537.7   9.25
 540.3 
 523.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  900.8   46.24
 859.6 
 808.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  976.9   38.37
 977.6 
 1043.7 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  783.3   12.09
 791 
 807 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  547.2   35.91
 611.5 
 607.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  505.1   9.54
 488.5 
 504.9 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  396.5   13.79
 410.2 
 424.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  449.2   5.81
 460.8 
 454.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  402.4   4.89
 411.2 
 403.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays