TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g17460
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  31.5   1.77
 34.8 
 34.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  69.6   3.76
 62.2  
 64.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  138   21.46
 96.5 
 126.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  124.3   28.64
 101.7 
 158.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  62.2   12.7
 87.5 
 73.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  47.1   9.93
 66.9 
 58.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  147.5   18.16
 162.4 
 183.7 
 1.03 Root (ATGE_94)  41.2   6.15
 30 
 31.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  26.6   5.51
 31 
 20.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  119.8   9.05
 130.5 
 137.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  141   36.46
 141.1 
 77.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  94.9   5.54
 85.9 
 96 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  108.5   18.23
 74 
 81 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  114.3   17.61
 138.2 
 103.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  64.2   5.12
 63.6 
 55 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  98.4   18.5
 70.4 
 105.3 
 3.20 Root (ATGE_93)  28.3   0.78
 28.2 
 29.6 
 3.20 Root (ATGE_98)  32.5   3.27
 26.9 
 32.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  21.3   5.41
 31.7 
 24.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  26   3.81
 27.7 
 33.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  102.9   30.03
 153.7 
 100.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  138.1   38.44
 158.4 
 212.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  119.2   8.8
 132.6 
 135.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  133.4   6.2
 145.6 
 137.9 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  124.3   25.33
 101.1 
 151.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  107.2   44.39
 182.4 
 103.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  162   28.18
 181.3 
 217.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  158.7   20.18
 122.6 
 125 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  152.6   18.81
 182.5 
 187.2 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  176.6   37.61
 130 
 102.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  88.1   12.97
 83.9 
 108.2 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  93.1   17.16
 59.2 
 71.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  51   9.28
 55.4 
 68.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  51.3   15.05
 80.7 
 60.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  81.6   13.29
 57.7 
 79.7 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  95.1   10.68
 98.1 
 114.9 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  41.1   4.05
 48.9 
 43.3 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  24.9   12.87
 33.9 
 50.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  50   5.17
 52 
 59.7 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  51.8   6.81
 65.3 
 60.1 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  90.6   30.74
 146.4 
 96.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  81.4   24.12
 87.3 
 125.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  59.1   14.61
 74.2 
 44.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  79.7   4.97
 69.9 
 76.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  65.1   7.19
 61.2 
 75.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  50.7   3.99
 44.2 
 43.4 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  37.4   9.28
 55.8 
 44.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  122.6   40.17
 179.5 
 101.9 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  57.1   6.5
 50.4 
 63.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  63.4   2.18
 60.7 
 59.1 
 6.50 Stem (ATGE_27)  126.8   21.44
 86 
 95 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  69.2   5.23
 79.6 
 75.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  66.8   13.88
 51.8 
 39.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  43.5   3.46
 50.3 
 48.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  40.7   8.04
 55.1 
 41.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  41.8   7.59
 37.4 
 52.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  31.4   3.95
 34.2 
 39.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  36.1   9.09
 43.1 
 54.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays