TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At5g19380
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  267.5   14.63
 277.3 
 296.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  277.6   18.53
 292.5  
 314.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  289.7   22.35
 305.9 
 333.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  294.9   38.23
 371.4 
 334.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  303.3   24.97
 326.1 
 276.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  331   13.84
 307.7 
 332.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  257.2   11.24
 275.5 
 255 
 1.03 Root (ATGE_94)  256   17.18
 224.9 
 253 
 1.03 Root (ATGE_95)  266.4   28.48
 263.3 
 314.1 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  282.1   19.46
 308.4 
 320.1 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  254.9   8.63
 250.3 
 267 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  247.7   18.73
 280.6 
 279.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  268.9   15.93
 295.6 
 297.3 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  227.6   17.8
 211.7 
 247.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  316.4   11.43
 313.5 
 334.6 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  234.3   20.91
 273.8 
 266 
 3.20 Root (ATGE_93)  340.2   10.98
 318.3 
 330.8 
 3.20 Root (ATGE_98)  273.7   12.91
 295.6 
 272.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  297.6   6.09
 303.7 
 309.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  275.7   18.74
 266.6 
 302.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  295.2   23.77
 248.8 
 280.9 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  272.9   5.6
 263.8 
 273.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  283.3   11.78
 289.3 
 266.6 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  298.1   9.87
 316.4 
 313.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  278.3   17.58
 277.2 
 308.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  260.6   35.44
 323.8 
 264.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  313   23.95
 325 
 359.2 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  292.5   5.82
 288.8 
 300.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  298.2   13.39
 319.1 
 294.2 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  310   6.39
 306.1 
 297.5 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  315.2   20.7
 347.4 
 308.7 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  304.6   13.33
 290.2 
 278 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  243.3   4.44
 234.4 
 239.2 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  281.7   23.79
 234.3 
 261.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  302.8   20.39
 343.6 
 323 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  286.5   9.62
 302.8 
 285.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  313   22.39
 314.3 
 352.4 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  504.4   3.02
 510.1 
 505.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  306.5   14.19
 313.7 
 286.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  280.7   11.42
 263.3 
 259.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  348.6   16.95
 357.7 
 324.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  317.7   23.43
 343.9 
 297.1 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  342.1   38.19
 319.4 
 267.6 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  312.7   27.7
 354 
 301.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  304   5.59
 308.7 
 297.6 
 6.00 Flower (ATGE_92)  346   13.17
 319.6 
 333.1 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  420.9   38.28
 368.9 
 443.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  335.3   11.64
 333.5 
 314.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  323   12.69
 301.1 
 300.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  386.2   12.18
 365.8 
 387.6 
 6.50 Stem (ATGE_27)  282.8   15.7
 314 
 294.9 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  192.4   33.97
 240.1 
 258.1 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  276.7   34.03
 267.8 
 330.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  375.7   3
 372.1 
 369.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  379.5   11.94
 355.8 
 365 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  382.4   18.94
 358.9 
 345 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  441.8   34.01
 376.9 
 391.8 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  390.8   19.56
 391 
 357 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays