TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g20650
TIGR annotation:copper transporter family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2158.4   84.29
 2325.6 
 2223.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  2401.9   63.84
 2324.6  
 2275.2 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1986.6   80.76
 1857 
 1838.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1597.9   95.8
 1436.4 
 1427.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1724.8   80.41
 1884.8 
 1819 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1804.5   95.68
 1814.7 
 1975.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1107.4   90.56
 1200.2 
 1288.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  2647.6   166.31
 2881.8 
 2969.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  3229.2   70.4
 3141.3 
 3280.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1648.3   52.73
 1724.4 
 1623.1 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1796.4   23.53
 1761.7 
 1751.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2491.6   58.23
 2375.2 
 2436.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2788.2   92.27
 2972.6 
 2885.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1810.6   153.29
 1554.2 
 1828 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2201.5   78.51
 2167 
 2051.6 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  2031   145.67
 1847 
 1743.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  2883.6   113.08
 2657.4 
 2771.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  3181.5   141.45
 2936.8 
 3182.1 
 3.20 Root (ATGE_99)  3095.1   73.78
 2947.8 
 3028.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  2354.6   56.6
 2314.3 
 2242.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  2066   168.67
 2400.6 
 2196.4 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1918.3   27.86
 1931.9 
 1971.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1805.3   52.16
 1894.6 
 1803.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  2499.6   96.22
 2319.8 
 2350.5 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2673.7   124.98
 2616.2 
 2434.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2302.9   48.43
 2325 
 2232.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2037.4   9.36
 2021.8 
 2038.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1881.7   21.43
 1904.9 
 1862.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1856   1.66
 1859.2 
 1856.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1826.6   33.59
 1858.2 
 1791 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2915.8   137.04
 2645.2 
 2742.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2891.1   124.33
 3057.4 
 3134.3 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  2572   57.96
 2687 
 2642.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2727.3   257.29
 2318.1 
 2792.9 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2648.7   156.53
 2364.4 
 2620 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2130   90.47
 2294.5 
 2277.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2165.1   57.82
 2207.7 
 2093.3 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  2820.8   123.39
 2868.7 
 2635.1 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1682   52.25
 1691.9 
 1777.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  2804.1   60.14
 2687.7 
 2771.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  2273.5   211.06
 1884.9 
 2222 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2227.6   95.86
 2109.4 
 2299.2 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  4736.2   436.68
 4362.1 
 3865.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  3241.5   189.23
 3513.7 
 3605.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  2450   52.81
 2352.9 
 2365.4 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2462.9   81.16
 2325.4 
 2468.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  607.1   40.24
 532.7 
 543.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  2513.5   132.72
 2299 
 2541.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2197.1   32.18
 2261.4 
 2231.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2721.2   156.53
 2464.5 
 2437.7 
 6.50 Stem (ATGE_27)  5595.5   120.83
 5353.9 
 5478.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2854.9   152.32
 3139.6 
 3090.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2959.7   158.15
 2827.9 
 2644.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  2445.6   35.98
 2511.5 
 2453.4 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  2161.9   56.31
 2140 
 2246.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  2035.1   80.03
 2188.5 
 2151.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  2290.5   66.89
 2180 
 2169.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  2180.5   274.54
 2640.2 
 2150.3 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays