TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g22580
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  249.5   25.15
 203.4 
 209 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  651   38.85
 670.2  
 725.8 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  525.1   40.53
 449.9 
 461.1 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1201.9   110.23
 987.4 
 1050.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1426.1   189.7
 1786.3 
 1709.3 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  2812.9   371.43
 2898.9 
 3494.9 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  870.8   110.26
 877.5 
 1065 
 1.03 Root (ATGE_94)  95.2   20.12
 109.1 
 134.8 
 1.03 Root (ATGE_95)  181.4   16.11
 155.9 
 151.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1920.3   74.26
 1999 
 2068.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  484.8   24.46
 495.4 
 448.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  849.6   62.29
 901.3 
 973.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2387.2   154.7
 2345.3 
 2100.8 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  599.2   40.04
 524.4 
 537.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  4115.7   212.05
 3766 
 3733.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  883.5   110.92
 851.6 
 1057.7 
 3.20 Root (ATGE_93)  196.9   10.14
 209.4 
 189.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  106   8.34
 121.9 
 109.7 
 3.20 Root (ATGE_99)  124   6.38
 111.4 
 115.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  311.5   42.23
 290.3 
 371.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  6656   359.12
 7356.1 
 6867.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1598.6   148.92
 1511.3 
 1801.6 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  3115.1   170.42
 2892.5 
 3227.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  2062.8   180.26
 2423.3 
 2244.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  930   101.55
 1037.7 
 834.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  3420.6   57.72
 3306.2 
 3350.2 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  4282.4   245.98
 3826.9 
 3893.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  4300.7   251
 4013.8 
 3800.5 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  4592.5   178.91
 4927.1 
 4650 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  3955.8   240.11
 3486.9 
 3631.8 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  3033.2   272.46
 2510.4 
 2904.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  3574.2   170.13
 3673.7 
 3905.7 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  1855   67.84
 1733.3 
 1846.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2141.2   411.05
 1955.7 
 2742 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  5693.2   670.55
 4369.4 
 5217 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1238.6   74.02
 1319.5 
 1386.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2223.4   73.86
 2356.3 
 2233.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1442.1   125.85
 1371 
 1615.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  4169.5   300.65
 4255.6 
 4727.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  4008.5   546.58
 5060.5 
 4791.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  5479.1   214.16
 5834.4 
 5449.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  293.4   4.63
 284.3 
 290.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1920.6   209.06
 2115.1 
 1697.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1440.7   69.65
 1364.6 
 1503.7 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  7546   440.71
 6725.9 
 7415.7 
 6.00 Flower (ATGE_92)  5000.6   63.76
 5076.8 
 4950.1 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  192.3   14.62
 164.1 
 185 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1435.9   116.15
 1203.8 
 1328.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  160.2   14.31
 188 
 180.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  3704.4   128.81
 3646 
 3457.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  5728.2   437.5
 4902.6 
 5566.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  694.6   28.52
 682.2 
 736.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  737.6   30.37
 747.8 
 690.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  980   95.2
 927.2 
 1112 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  863.3   32.83
 894 
 828.4 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  157.7   4.17
 149.5 
 152.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  136.3   15.36
 136.7 
 109.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  107.4   12.09
 127.4 
 129.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays