TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g23540
TIGR annotation:26S proteasome regulatory subunit, putative
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2005.2   33.99
 2069.9 
 2055.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1620.3   43.32
 1559.7  
 1536.4 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1367.6   28.49
 1378.1 
 1324.3 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1563.7   96.34
 1426.5 
 1377.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  2668   127.64
 2576.4 
 2828.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  3345.3   142.62
 3089.1 
 3108.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1238.6   19.24
 1266.5 
 1275.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  1840.1   62.34
 1871.6 
 1960.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  1943.9   59.98
 2031.8 
 2058.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1547.5   26.64
 1599.9 
 1565.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1241.4   92.22
 1365.6 
 1421.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1338.7   65.68
 1460 
 1443.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1422.3   72.6
 1374.5 
 1517.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1623.9   94.26
 1549.1 
 1736.4 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2744.3   145.89
 2849.6 
 2561.3 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  1997.6   15.95
 2019.8 
 2028.5 
 3.20 Root (ATGE_93)  2069.2   14.3
 2049.6 
 2041.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  1726.7   44.78
 1775.2 
 1816.1 
 3.20 Root (ATGE_99)  1860.5   65.77
 1735.8 
 1834.7 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1983.2   33.63
 1921.6 
 1928.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1520   32.56
 1460.3 
 1467.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1377.5   12.08
 1367.8 
 1391.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1495.8   50.42
 1440.3 
 1395.2 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1309.1   29.87
 1320.9 
 1365.7 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1384.8   110.22
 1296 
 1515.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1389.2   32.09
 1335.5 
 1392.8 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1364.9   39.82
 1298.9 
 1293.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1287.5   46.2
 1330.3 
 1379.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1428.5   61.65
 1485.8 
 1362.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1462.2   28.93
 1515.4 
 1508.4 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1325.5   33.94
 1357.3 
 1289.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1371   20.42
 1369.9 
 1405.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  3274.2   92.52
 3310.7 
 3135.3 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  2372.6   166.32
 2049.3 
 2278.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2181.7   169.77
 2410.1 
 2078.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2229.2   25.47
 2273.3 
 2229.3 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2020.1   40.27
 2005.7 
 2081.6 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  2240.4   191.77
 2506.2 
 2133.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1988.7   14.87
 1974.9 
 2004.6 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  2302.7   143.26
 2032.3 
 2085.4 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1603.7   38.81
 1529.2 
 1585.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  3948.4   136.54
 4164.4 
 3911.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  3053.4   156.8
 2884.2 
 2740.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  2209.5   122.63
 2337.1 
 2092 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  2622.5   76.51
 2612.3 
 2485.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2344.8   154.92
 2497 
 2654.6 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  542   23.49
 540.4 
 500.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1608.8   77.77
 1696 
 1764 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2411.8   150.62
 2347.9 
 2124.9 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2368.4   113.79
 2150.1 
 2203.7 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1676.2   110.02
 1702.3 
 1500 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2159   88.8
 2318.5 
 2171 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2348.2   40.23
 2272.4 
 2333.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1927   55.85
 2029.6 
 2016.6 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1799.9   110.63
 1854.8 
 2013 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  2211.7   40.04
 2248.8 
 2168.8 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  2542.4   61.32
 2425.1 
 2452.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  2534.5   128.55
 2474.1 
 2287.8 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays