TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g24270
TIGR annotation:calcineurin B-like protein, putative / calcium sensor homolog (SOS3)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  372.8   8.93
 362.6 
 380.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  198.6   11.4
 220.8  
 214.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  177.1   13.88
 156.2 
 182.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  187.7   14.45
 188.2 
 213 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  129.4   7.27
 142.7 
 131 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  133.6   10.18
 142.6 
 122.3 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  208.2   46.05
 280.9 
 195.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  618.4   30.31
 565.5 
 566.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  444.8   29.91
 502.2 
 488 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  188   19.67
 219.9 
 184 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  169.1   29.3
 148.9 
 206.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  368.2   6.47
 360.6 
 355.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  272.5   27.39
 252.3 
 306.5 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  193.5   33.16
 146.2 
 210.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  113.7   15.6
 110.7 
 139.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  119.1   19.26
 157.6 
 140 
 3.20 Root (ATGE_93)  463.3   30.44
 475.2 
 521 
 3.20 Root (ATGE_98)  696.6   31.54
 648 
 707.1 
 3.20 Root (ATGE_99)  483.2   9.99
 502.9 
 490.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  240.5   16.08
 254.8 
 222.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  191.4   15.67
 205.6 
 174.3 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  179.1   10.38
 196.6 
 197.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  203.9   25.24
 230.3 
 179.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  216.8   29.89
 185 
 244.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  226   5.37
 236.6 
 232.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  183.8   7.69
 198.5 
 187.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  186   4.24
 193.9 
 192.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  189.2   6.72
 183.4 
 175.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  188.5   1.24
 190.7 
 188.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  220.9   26.22
 222.3 
 176.2 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  343.4   29.79
 348.9 
 397.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  242.6   19.06
 280.4 
 257.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  165.5   31.98
 115.2 
 106.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  129.1   4.96
 138.8 
 135.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  253.7   10.87
 252.6 
 272 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  214.7   3.35
 219.5 
 213.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  104.1   28.91
 118.2 
 159.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  213.7   23.86
 222 
 177.1 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  184.2   9.32
 169.8 
 187.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  409.6   8.11
 414.7 
 398.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  312.1   8.71
 294.9 
 306 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  179.6   13.6
 197.6 
 170.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  163.9   12.29
 158 
 140.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  229.8   9.24
 211.4 
 222.1 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  174   3.39
 170.2 
 167.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  177.3   18.21
 145.1 
 146.5 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  209.4   17.86
 245 
 229 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  162.4   6.99
 168 
 176.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  215.6   9.45
 226 
 207.1 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  131   3.75
 124.4 
 130.8 
 6.50 Stem (ATGE_27)  153.8   4.08
 161.2 
 154.7 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  79   12.29
 84.3 
 102.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  115.9   13.22
 92.1 
 114 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  128.6   1.12
 130.5 
 128.5 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  198.4   7.92
 196.5 
 211.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  266.5   34.75
 234.6 
 304 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  267.5   20.72
 308.1 
 295 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  327.6   22.02
 335.4 
 294 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays