TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g27830
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  324.8   9.37
 321.5 
 307.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  376.4   14.52
 365.4  
 347.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  410.9   17.45
 412.2 
 441.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  228.4   7.06
 228.9 
 240.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  272   11.45
 249.4 
 263.7 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  287.3   30.01
 282.3 
 233 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  224.4   13.24
 220.7 
 199.8 
 1.03 Root (ATGE_94)  251.5   17.31
 282.3 
 253.3 
 1.03 Root (ATGE_95)  255.1   10.31
 261.7 
 241.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  285.1   13.05
 298.8 
 272.7 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  218.8   8.67
 235.5 
 231.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  292.1   8.12
 275.9 
 282.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  295.5   7.64
 280.3 
 289.7 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  231.9   19.21
 269.4 
 243.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  366.5   7.4
 381.3 
 373 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  257.7   7.81
 244.1 
 257.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  323.1   9.49
 320.5 
 305.6 
 3.20 Root (ATGE_98)  251.6   7.54
 248.5 
 262.8 
 3.20 Root (ATGE_99)  259.6   10.85
 269.4 
 281.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  284.5   11.23
 291.8 
 269.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  346.8   14.59
 375.9 
 359.5 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  504   32.37
 511.3 
 451.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  425.9   9.21
 440.7 
 442.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  288.1   5.19
 289.4 
 297.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  465.4   15.58
 458.3 
 488.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  569.7   23.03
 574 
 532.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  472.8   21.12
 477.3 
 511.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  398   30.18
 392.3 
 447.2 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  379.9   4.99
 370 
 376 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  300.8   27.06
 327.1 
 273 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  314.5   14.53
 290.1 
 288.7 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  304.3   6.79
 296.3 
 290.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  350   12.71
 341.5 
 366.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  321.8   6.22
 334 
 330.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  329.5   5.79
 334.6 
 323.1 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  334.4   20.58
 375.5 
 354.1 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  318.5   13
 318.1 
 295.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  306.7   35.72
 269.4 
 340.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  371.5   4.09
 369.8 
 363.8 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  434.4   19.86
 416.1 
 394.7 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  379.3   30.67
 427.4 
 370.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  611.4   21.75
 641.7 
 653.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  237.3   17.83
 217.9 
 253.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  231.5   10.32
 249.3 
 249.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  391   13.76
 367.7 
 392.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  297.8   16.31
 330.2 
 316.8 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  137.4   13.1
 163.5 
 152.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  518.8   16.84
 552.1 
 539.5 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  713.4   28.78
 655.9 
 687.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  348   5.03
 338.1 
 341.6 
 6.50 Stem (ATGE_27)  381.3   9.66
 387.6 
 400.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  283.4   10.05
 292.2 
 272.2 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  260.4   20.42
 301 
 284.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  312.7   27.95
 363.9 
 318.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  297.3   5.89
 291.8 
 285.5 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  206.2   9.96
 224.7 
 208.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  164.4   8.77
 158.2 
 175.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  189.8   9.98
 177.7 
 170 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays