TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g44070
TIGR annotation:phytochelatin synthase 1 (PCS1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  983.8   28.77
 1036.7 
 1029.9 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1190.9   42.35
 1275.6  
 1231.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1904.6   113.68
 2122.5 
 2069.7 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1351.5   54.06
 1337.4 
 1251.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  981.5   75.43
 993.2 
 1117.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  723.7   18.25
 687.4 
 708.7 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  839   46.48
 806.9 
 747.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  928.5   14.1
 900.4 
 912.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  898.7   26.22
 947.4 
 939.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  832.4   15.51
 862.5 
 854.2 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  762   49.55
 833.9 
 857 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  3789.7   67.49
 3659.4 
 3755.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1662.3   27.73
 1638.8 
 1694.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  654.1   45.38
 718.1 
 741.8 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  806.8   51.32
 799.6 
 714.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  685.7   56.6
 781.6 
 681.5 
 3.20 Root (ATGE_93)  883.7   30.77
 892.3 
 835.2 
 3.20 Root (ATGE_98)  882.3   14.36
 873.5 
 901.6 
 3.20 Root (ATGE_99)  700.1   17.46
 732.3 
 704.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1004.9   46.9
 1040.4 
 947.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1847.8   57.39
 1733.1 
 1794.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  2594   92.14
 2745.3 
 2578.4 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  2612.9   59.11
 2637.1 
 2524.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  809.1   15.02
 785 
 812.6 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1807.4   108.44
 1848.2 
 1643.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2236.9   19.13
 2274.1 
 2247.6 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  2373.9   78.1
 2519.1 
 2396.8 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  2201   96.11
 2199.7 
 2366.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  2211.3   97.34
 2279.1 
 2087.2 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1864.7   124.75
 2092 
 1889.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2416.4   81.44
 2276.8 
 2274 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1926.3   66.17
 1853.7 
 1794.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  767.7   18.18
 800.1 
 769.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  883.1   59.15
 764.9 
 828 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  584.9   69.36
 723 
 665.8 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1377.8   88.44
 1550.4 
 1430.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  592.7   29.91
 538.2 
 586.7 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  314.1   19.21
 325.2 
 287.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  587.9   23.29
 564.7 
 541.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1356.8   86.95
 1225.2 
 1192.6 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1304.6   25.43
 1291.3 
 1255.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2151   104.34
 2307.7 
 2348.7 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1352.5   101.08
 1229.5 
 1429.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  673.4   27.95
 727.9 
 711.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  762.5   14.88
 755.6 
 734 
 6.00 Flower (ATGE_92)  654.4   37.54
 706.1 
 727.5 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  114.5   5.75
 109.9 
 103.1 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1826.4   8.57
 1837 
 1843.4 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2133.1   161.71
 1924.7 
 1814.7 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  879.3   21.62
 837.9 
 869.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1347.5   22.22
 1379.2 
 1390.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  539.8   22.22
 496 
 511.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  433.4   10.9
 444 
 422.2 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  195.5   19.01
 210.4 
 233.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  149.1   0.57
 149.9 
 148.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  82.6   2.02
 78.6 
 80.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  157.1   25.49
 194.4 
 205.9 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  114.2   5.52
 109.3 
 103.2 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays