TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g46830
TIGR annotation:basic helix-loop-helix (bHLH) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  26   1.73
 24 
 22.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  24.6   0.92
 22.9  
 24.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  19.8   5.28
 18.5 
 28.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  21.7   0.81
 22.1 
 20.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  38.1   2.51
 33.3 
 36.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  51.8   4.65
 54.9 
 45.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  47.3   3.32
 43.3 
 49.9 
 1.03 Root (ATGE_94)  22.4   4.48
 14.3 
 21.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  14.4   7.5
 28.9 
 18.6 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  33.2   2
 34 
 30.2 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  25.9   2.05
 29.1 
 29.7 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  28.3   5.39
 20.6 
 18 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  28.9   6.89
 39.5 
 26.5 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  33.1   3.53
 40.1 
 36.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  32   0.61
 32.1 
 33.1 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  40   4.32
 38.9 
 32 
 3.20 Root (ATGE_93)  22.2   0.65
 22.6 
 23.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  28.4   2.65
 24.6 
 23.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  24   1.96
 24.3 
 20.8 
 3.20 Roots (ATGE_9)  18.9   2.56
 22.6 
 17.7 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  29   2.35
 30.8 
 26.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  24.5   5.92
 22.6 
 33.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  37   3.46
 34.5 
 41.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  29.6   9.79
 25 
 43.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  25.2   3.73
 32.6 
 28 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  25.9   1.94
 22.8 
 26.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  23.4   2.04
 26.7 
 23 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  25.1   2.83
 30.7 
 27.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  28   1.2
 30 
 27.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  32.8   5.51
 34.1 
 24 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  21   3.95
 22.8 
 28.6 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  23.6   2.08
 20.1 
 23.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  27.7   2.85
 33.4 
 30.5 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  15.6   6.68
 27.7 
 26.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  24.2   1.44
 21.7 
 24.2 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  25.8   1.55
 26.6 
 23.6 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  27.7   2.68
 26.3 
 31.5 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  26.7   7.17
 31.4 
 17.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  38.1   2.54
 33.5 
 34 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  27.4   1.46
 30.2 
 29.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  29.9   6
 22.8 
 18 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  28.5   5.4
 39.3 
 33.9 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  36.5   5.23
 26.4 
 29.1 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  27.6   0.57
 26.4 
 26.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  30.2   3.01
 30.5 
 25.1 
 6.00 Flower (ATGE_92)  24.5   3.74
 19.1 
 17.3 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  25.7   7.33
 39.9 
 36.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  22.6   0.6
 23.7 
 23.4 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  24.5   4.34
 21.8 
 30.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  33.3   1.06
 31.5 
 33.5 
 6.50 Stem (ATGE_27)  24   5.03
 29.4 
 19.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  35.5   5.11
 42.4 
 45.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  29.6   5.82
 29.7 
 19.6 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  23.9   2.9
 20.9 
 18.1 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  19.2   1.39
 17.1 
 16.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  23.6   3.53
 30.4 
 25.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  26.6   3.77
 19.1 
 22.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  17.6   9.53
 34 
 17.3 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays