TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At5g47740
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  129.3   5.81
 123.6 
 117.6 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  48.4   4.05
 40.3  
 44.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  49.2   2.74
 43.8 
 45.6 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  46.7   4.46
 55 
 48.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  44.6   2.28
 48.5 
 44.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  46.9   2.49
 51.8 
 50.2 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  33.5   4.12
 39.3 
 41.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  128.9   12.12
 134.4 
 152.1 
 1.03 Root (ATGE_95)  230.7   12
 215.8 
 206.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  47.6   3.67
 49.5 
 42.4 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  46.2   2.19
 45.3 
 42.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  50.8   0.95
 51.8 
 52.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  72.9   8.36
 56.8 
 61 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  38.7   0.48
 39 
 39.6 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  46.2   3.03
 45.1 
 50.8 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  37.8   1.97
 41.2 
 41.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  127.4   18.27
 155.9 
 161.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  230.7   13.45
 208.1 
 232 
 3.20 Root (ATGE_99)  342.9   18.1
 379 
 358.9 
 3.20 Roots (ATGE_9)  78.7   6.16
 86.3 
 90.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  41.6   5.33
 47.6 
 36.9 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  44.8   17.15
 34.3 
 67.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  48.5   4.41
 39.7 
 44.8 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  47.8   1
 49.3 
 49.7 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  42.6   4.28
 48.7 
 50.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  41.2   5.03
 46 
 35.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  47.6   6.03
 49.9 
 38.5 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  44   3.25
 43.2 
 38 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  42   5.26
 52 
 49.8 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  47.3   1.6
 44.5 
 44.5 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  54.1   5.9
 42.7 
 50.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  77.7   4.06
 72.5 
 80.6 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  51.3   2.55
 52.8 
 47.8 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  65.8   6.08
 67.5 
 77.1 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  48.6   7.54
 58.9 
 44.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  42.1   2.7
 47.5 
 45.2 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  37.8   6.11
 48.5 
 48.3 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  65.2   9.51
 50.5 
 47.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  63.7   8.41
 69 
 80.2 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  47.8   3.93
 43.8 
 39.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  41.6   9.4
 59.8 
 54.9 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  54   1.29
 56.5 
 54.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  66.8   11.23
 53.1 
 44.6 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  47.1   9.07
 64.5 
 51.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  32   5.46
 36.9 
 42.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  62.1   0.83
 60.5 
 61.8 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  94.4   10.72
 73.1 
 85.7 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  43.6   2.06
 46.9 
 43.2 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  60.6   1.09
 58.9 
 58.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  47   2.91
 42.8 
 41.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  38.1   3.34
 42.9 
 44.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  38.7   4.21
 40.8 
 46.8 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  41.8   2.15
 40.7 
 44.8 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  46.5   4.2
 50.4 
 42 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  48.3   1.17
 49.6 
 50.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  62.4   7.65
 76 
 75.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  65.9   3.73
 62.9 
 70.3 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  79.7   9.05
 69.8 
 87.9 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays