TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g50350
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  309.6   4.1
 302.9 
 310.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  204.4   12.38
 225.9  
 204.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  227   7.08
 240.4 
 229.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  280.8   10.63
 274.2 
 260 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  401   9.79
 420.4 
 408.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  474.4   32.67
 492.8 
 537.9 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  299   9.22
 298.3 
 314.6 
 1.03 Root (ATGE_94)  239.5   16.09
 221.6 
 253.7 
 1.03 Root (ATGE_95)  240.3   6.52
 233.3 
 246.3 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  284.5   13.01
 303 
 309.5 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  285.5   12.56
 310.1 
 293.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  200.3   15.66
 226.7 
 228.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  253.6   24.14
 293 
 249.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  324.7   24.14
 364.5 
 321 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  547.6   6.49
 555.7 
 560.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  338.5   32.38
 359.1 
 401.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  272.4   18.66
 298.9 
 262.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  227.5   20.64
 260.5 
 222.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  246.2   16.13
 234.3 
 214.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  271.5   16.12
 267.6 
 297.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  286.4   28.39
 230.7 
 268.1 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  236   24.37
 268.5 
 283.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  258.9   11.3
 241.2 
 237.9 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  280.1   21.3
 258.2 
 237.5 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  227.3   12.68
 244 
 219.1 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  242.2   7.16
 246.2 
 232.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  225.5   21.98
 260.1 
 266.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  256.2   13.58
 249.9 
 230.1 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  273   4.24
 276.6 
 268.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  283.2   19.77
 322.7 
 301.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  238.2   27.41
 196 
 186.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  244.5   4.91
 251.2 
 254.1 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  459.2   38.66
 535 
 484.3 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  470   40.13
 470.3 
 400.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  432   11.78
 454.9 
 448.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  321.3   33.02
 294.1 
 359.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  615   25.26
 565.9 
 580.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  281.5   8.41
 291.9 
 275.2 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  517.8   24.15
 502.8 
 550.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  402.5   9.14
 411.4 
 393.2 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  253.4   8.6
 240.1 
 256.1 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  438.4   18.02
 470.6 
 468.5 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  363.1   6.64
 366.5 
 353.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  492.9   23.4
 451.2 
 453.8 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  427.1   10.18
 406.8 
 417 
 6.00 Flower (ATGE_92)  448.8   16
 417.1 
 436.9 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  115.5   12.72
 140.9 
 128.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  293.6   12.88
 319.1 
 303.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  379.2   29.22
 393.6 
 337.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  298.5   24.98
 268 
 249 
 6.50 Stem (ATGE_27)  193.2   6.1
 202 
 204.9 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  308.2   45.24
 291.1 
 376.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  342.4   11.88
 344 
 363.7 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  395.5   8.21
 407.8 
 392.3 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  439.2   9.67
 432.1 
 451.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  411.1   49.9
 452.3 
 510.5 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  523.8   2.02
 527 
 523.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  534   21.13
 503 
 493.6 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays