TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g54070
TIGR annotation:heat shock transcription factor family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  12.6   0.41
 12.3 
 11.8 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  11.8   1.65
 11.8  
 14.7 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  18.7   1.87
 22.4 
 19.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  11.1   1.71
 14.5 
 13.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  14.1   2.89
 17.3 
 19.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  16.1   2.11
 11.9 
 14.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  19.8   2.39
 22.2 
 17.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  16.2   3.93
 17.9 
 10.4 
 1.03 Root (ATGE_95)  13.5   4.02
 20.2 
 12.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  14.2   3.61
 18.4 
 11.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  13.8   3.69
 18.9 
 20.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  11.1   2.38
 15.7 
 12.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  15.4   0.83
 13.8 
 14.2 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  11.6   3.59
 17.4 
 10.9 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  17   1.21
 19.3 
 17.6 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  12   4.29
 14.2 
 20.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  15.2   1.47
 16.7 
 13.8 
 3.20 Root (ATGE_98)  23.5   3.89
 18.3 
 15.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  15.6   0.5
 14.6 
 15.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  13.6   1.39
 12.5 
 15.3 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  13.8   0.72
 15.2 
 14.3 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  11.5   4.17
 19.8 
 15.8 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  16.1   2.93
 12.7 
 18.5 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  17   1.76
 13.9 
 13.9 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  14.6   2.8
 10.7 
 9.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  14.7   1.89
 17.9 
 14.7 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  13.1   3.27
 19.6 
 15.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  13   1.16
 15.2 
 13.5 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  11.6   3.29
 16.7 
 10.6 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  13.8   3.36
 15.9 
 9.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  11.4   1.57
 13.5 
 10.5 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  11.4   1.72
 11.5 
 8.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  11.1   5.06
 20.2 
 11.7 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  13   1.84
 16.7 
 14.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  14.7   5.66
 23.8 
 13.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  17.8   2.01
 17.9 
 14.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  20.4   5.09
 16 
 10.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  17.5   1.46
 18.6 
 15.8 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  17.4   3.89
 16.2 
 10.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  18.4   3.26
 13.2 
 19.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  13   2.18
 16.1 
 17.2 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  16.4   4.03
 16.9 
 23.6 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  11.2   5.37
 13.3 
 21.4 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  11.5   0.28
 11 
 11.4 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  14.8   2.59
 16 
 11 
 6.00 Flower (ATGE_92)  15.8   1.2
 15.2 
 13.5 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  24.2   4.7
 27.1 
 33.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  18.9   0.96
 17.4 
 17.1 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  18.6   1.11
 18 
 16.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  13.1   3.22
 7.2 
 12.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  19.4   5.82
 14.2 
 25.9 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  11.1   2.51
 15.4 
 11 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  21.7   6.38
 9 
 17 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  19.8   3.45
 12.9 
 16.7 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  22.8   3.74
 16.5 
 23.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  417.9   11.96
 441.2 
 424.5 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  571.4   51.23
 641.4 
 541.6 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  848.4   10.31
 839 
 827.8 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays