TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g54430
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1774.9   51.6
 1854.2 
 1757.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1956.5   127.72
 1701.1  
 1827 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1258.6   12.74
 1235.4 
 1237.8 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1195.1   102.78
 1000.1 
 1041.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  2130.1   86.8
 2268.4 
 2290.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  3159.9   137.45
 3339.7 
 3429.9 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1066.9   32.44
 1130.5 
 1087.3 
 1.03 Root (ATGE_94)  2003.9   32.14
 1939.6 
 1970.6 
 1.03 Root (ATGE_95)  1701.1   90.75
 1702.3 
 1858.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1207.7   63.08
 1322.3 
 1219.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1227.8   23.4
 1181.2 
 1208.6 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1551.1   33.05
 1502.8 
 1566.1 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1673.3   50.42
 1580.5 
 1661.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1506.8   75.53
 1568 
 1657 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  3673.8   213.89
 3678.1 
 3305.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  1955.6   97.62
 1948.7 
 1783.2 
 3.20 Root (ATGE_93)  1686.8   137.51
 1628.7 
 1424.9 
 3.20 Root (ATGE_98)  2245.7   87.83
 2137.9 
 2312 
 3.20 Root (ATGE_99)  1961.7   102.16
 1999.6 
 2154.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1838.4   37.39
 1799.9 
 1763.6 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1374.9   76.14
 1512.3 
 1386.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1220.5   0.26
 1220.9 
 1221 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1169.5   29.97
 1192.8 
 1133.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1399.6   25.6
 1350.1 
 1386.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2140.1   66.71
 2186.7 
 2271.6 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1735.9   75.15
 1745 
 1610.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1405   82.27
 1330.3 
 1240.7 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1174.5   7.59
 1180.3 
 1189.5 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1253.1   31.98
 1279.2 
 1215.5 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1274.6   16.65
 1246.3 
 1275.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2151.1   237.44
 1682.2 
 1982 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2317   109.36
 2133.2 
 2327.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  3481.9   164.59
 3629.8 
 3810.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  3164.2   111.78
 2942.6 
 3027.5 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2904.2   184.15
 2857.9 
 3197.5 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1861.7   40.35
 1913.5 
 1941.2 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2236.4   53.19
 2130.1 
 2179.1 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1918.5   24.29
 1942.9 
 1894.4 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  2238.8   76.65
 2203.4 
 2350.3 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  2013.3   47.73
 1983.5 
 1919.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1404.9   41.9
 1475.9 
 1479 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  2451.1   211.52
 2609.8 
 2190.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  2125.9   241.77
 1747.6 
 1676 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  1751.4   102.6
 1788 
 1594.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  3200.8   157.48
 3120.3 
 2896.8 
 6.00 Flower (ATGE_92)  3037.5   105.47
 3223.9 
 3045.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  435.9   14.91
 417 
 406.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1821.2   38.35
 1780.1 
 1856.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  3050.5   34.65
 3053.9 
 2992.2 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  2434.9   175.91
 2092.8 
 2192.9 
 6.50 Stem (ATGE_27)  2422   68.34
 2558.2 
 2500 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2378.2   197.81
 2522.6 
 2769.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2181.4   117.07
 1974.2 
 1983.4 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1288.7   49.41
 1380.6 
 1366 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1310.1   19.78
 1292.2 
 1270.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1423.7   45.02
 1496.3 
 1413.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1513.5   49.08
 1425.3 
 1506.8 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1578.9   51.03
 1672.6 
 1590.5 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays