TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g59030
TIGR annotation:copper transporter 1 (COPT1)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  236.1   21.98
 225.1 
 267.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  658.8   44.48
 570.8  
 603.5 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1571.9   94
 1421.7 
 1398.9 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  899.8   16.54
 909.3 
 877.1 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  798.8   67.29
 907.7 
 784.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  700.5   65.93
 601.8 
 726.8 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  621.2   56.14
 604.9 
 709.3 
 1.03 Root (ATGE_94)  293.8   31.92
 266.6 
 330.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  332.3   17.96
 296.5 
 317.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  931.4   46.18
 1009.4 
 927.5 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1089.5   38.85
 1078.5 
 1017.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2434.7   46.47
 2527.6 
 2479.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2075.5   96.77
 2014.5 
 1885.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1015.2   31.47
 998.1 
 954.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  544   44.44
 541.1 
 619.5 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  891   13.46
 868 
 891.7 
 3.20 Root (ATGE_93)  412.8   20.57
 373.2 
 383.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  393.5   16.58
 377.6 
 360.3 
 3.20 Root (ATGE_99)  531.8   25.78
 490.4 
 484.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  240.2   11.48
 234.8 
 218.2 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  964.1   38.96
 1023.1 
 1037.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1431.7   51.68
 1401.1 
 1501.9 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1343.8   41.8
 1313.8 
 1261.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1730.1   89.04
 1895.5 
 1870.1 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2157.1   58.07
 2265.8 
 2176.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1648.9   204.62
 2030.7 
 1712.3 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1704.7   96.58
 1534.8 
 1699.4 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1276.4   86.43
 1186.1 
 1103.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1153.3   78.5
 1279.2 
 1134.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1090.8   13.06
 1066.8 
 1069.7 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  3313.9   356.37
 2739.9 
 2660.9 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2903.6   199.63
 2555.1 
 2560.7 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  750.8   36.66
 758.9 
 818 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1240.9   169.77
 919.3 
 1174.2 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  1745.8   144.34
 1463.4 
 1656.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2084.5   174.27
 2042.3 
 2363 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  890.9   18.98
 868.5 
 853.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  2703.9   83
 2867.6 
 2809.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  647.7   33.89
 618.3 
 685.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1232.4   112.71
 1446.4 
 1400.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1240.6   41.12
 1319.2 
 1301.1 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1739.2   166.53
 1518.5 
 1412.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  1169.8   63.73
 1186.4 
 1068.7 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  2652.6   86.39
 2494.9 
 2634.9 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  758.6   13.08
 732.6 
 748 
 6.00 Flower (ATGE_92)  1218.8   74.23
 1070.7 
 1136.8 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  4759.6   147.09
 4471.2 
 4665.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1899.5   88.25
 1760.6 
 1924.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1317.7   70.81
 1232 
 1372.5 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1193.3   46.99
 1147.7 
 1099.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  891.2   54.1
 783.1 
 833.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1105.8   37.23
 1153.7 
 1080.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1274.9   23
 1305.9 
 1261 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1603   8.77
 1598.2 
 1615.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1461.7   46.01
 1521.2 
 1552.2 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1352.5   51.54
 1300.1 
 1403.1 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  917.1   110.83
 1107.6 
 1110.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1026.6   5.33
 1017.7 
 1017 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays