TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At5g59550
TIGR annotation:zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  1616.5   53.14
 1678.4 
 1722.3 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1422.8   134.11
 1662.3  
 1647.1 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1674   24.42
 1692.7 
 1722.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1391.5   48.58
 1311.4 
 1303.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1530.8   34.84
 1584.5 
 1519.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  1293.3   33.74
 1323.4 
 1360.7 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  572   80.33
 726.4 
 687.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  673.6   17.21
 678.4 
 705.5 
 1.03 Root (ATGE_95)  670.8   5.85
 673.2 
 681.9 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  795.8   38.6
 725.7 
 788.8 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  938.8   25.48
 911.4 
 962.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1841.4   166.22
 1780.4 
 1527.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1457.2   30.27
 1466.6 
 1513.7 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  845.4   15.77
 826 
 857.2 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  454.1   15.56
 475.5 
 484.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  868.4   64.5
 877.5 
 761.5 
 3.20 Root (ATGE_93)  725.4   17.19
 720.4 
 693.4 
 3.20 Root (ATGE_98)  868.2   20.25
 874.1 
 905.9 
 3.20 Root (ATGE_99)  756   25.42
 806.6 
 776.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  2360.7   47.56
 2449.2 
 2374.8 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1083.9   11.15
 1103.1 
 1083.7 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1402.3   81.73
 1355.7 
 1514.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1209.9   28.36
 1264.7 
 1224.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  976.8   22.9
 1004.8 
 959.4 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1410.3   38.98
 1332.3 
 1371.8 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1521.1   75.52
 1453.3 
 1604.1 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1551.8   82.2
 1710.1 
 1669.3 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1593   30.7
 1601.1 
 1544.3 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1365.2   21.78
 1400.4 
 1405.1 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1386   134.23
 1642.7 
 1446.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2691   197.96
 3081.7 
 2942 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  3007.4   125.82
 2824.1 
 2766.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  585.9   26.64
 609.1 
 556 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  677.8   45.02
 624.2 
 713.7 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  540.3   75.17
 687.8 
 639.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1409.9   45.5
 1383.8 
 1321.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1022.1   19.45
 986.2 
 1017.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1337.4   89.54
 1287.5 
 1163.5 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1342.7   13.98
 1340.4 
 1317.4 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  799.4   33.15
 741 
 797.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  977.2   113.93
 782.5 
 982.3 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1106.5   46.53
 1051.3 
 1014 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  972.7   51.82
 1075.9 
 1016.4 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  965.5   33.79
 901.5 
 952.3 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1143.9   37.55
 1071.8 
 1089.5 
 6.00 Flower (ATGE_92)  612.2   49.79
 532.2 
 623.5 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  1913.7   248.8
 2314.2 
 1858.2 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1293.8   36.71
 1264.8 
 1337.7 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  1339.2   26.08
 1391.2 
 1362.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  780.6   31.96
 843.1 
 800.2 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1308.4   33.54
 1263.1 
 1328.6 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1176.5   134.21
 909.4 
 1019.7 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1011.7   53.65
 1032.7 
 931.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  808.8   25.25
 859.3 
 832.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  804.4   13.9
 814.4 
 831.9 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1120.6   52.97
 1103.1 
 1202.3 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  929.2   61.97
 930.3 
 1037.1 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1265.3   61.71
 1187.6 
 1143.4 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays