TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g60640
TIGR annotation:thioredoxin family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  2076.4   20.96
 2073.4 
 2038.7 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1786.3   29.09
 1753.1  
 1728.3 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1115.3   34.23
 1177.6 
 1171.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  1172.6   65.43
 1058.7 
 1059.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  1794.3   135.86
 2064.3 
 1903.5 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  2100.6   141.03
 2157.6 
 2368.4 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  1288.9   23.02
 1244.6 
 1256 
 1.03 Root (ATGE_94)  1777.8   28.98
 1749.2 
 1807.1 
 1.03 Root (ATGE_95)  1752.2   41.61
 1782.2 
 1834.4 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  1155.9   6.2
 1143.5 
 1149.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1133.7   24.65
 1127.9 
 1173.2 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  1082.7   26.28
 1122.6 
 1132.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  1323.2   13.17
 1324.3 
 1300.9 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  1335.1   52
 1439 
 1389.4 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2464.2   94.23
 2579.9 
 2393.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  1515.8   97
 1553.9 
 1699.6 
 3.20 Root (ATGE_93)  1503.9   111.68
 1699.3 
 1508 
 3.20 Root (ATGE_98)  1779.2   68.1
 1866.7 
 1732.5 
 3.20 Root (ATGE_99)  1962   52.69
 1869.3 
 1872.3 
 3.20 Roots (ATGE_9)  1785.9   79.02
 1788.2 
 1923.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  1426.9   8.64
 1431.5 
 1414.8 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1258.3   9.44
 1243.2 
 1260.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  1274.8   30.56
 1262 
 1216.7 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1094.2   29.18
 1131.7 
 1074.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1444.1   56.01
 1539.9 
 1441.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1386.7   17.37
 1364.1 
 1352.5 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1176.8   53.18
 1251.8 
 1279.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  1299.1   44.5
 1212.6 
 1237.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  1277.1   10.4
 1290.2 
 1269.7 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  1329.3   24.49
 1376.4 
 1364.3 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  1313.5   65.43
 1187.8 
 1219.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  1378.3   31.44
 1316.3 
 1356.4 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  3013.8   82.16
 3157.8 
 3017.1 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  3340.5   171.62
 3084.2 
 3410 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2160.2   6.42
 2162.4 
 2172.3 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  1074.3   33.88
 1076.4 
 1134 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  2197.6   18.51
 2198.1 
 2165.8 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  1645.5   48.52
 1683.4 
 1587.1 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  2061.8   42.52
 2073.1 
 2140.4 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1183.3   39.01
 1211.9 
 1260.5 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  1227.6   43.74
 1271 
 1183.6 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  1020.4   19
 1038.9 
 1058.4 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  813.6   23.2
 859.7 
 831.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  883.1   52.64
 894 
 979.2 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  2076.6   78.69
 1929.3 
 2050.9 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2715.6   184.96
 2967.8 
 3076 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  522.5   61.54
 418.5 
 413.5 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  1478   122.79
 1715.3 
 1542 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  2116.2   91.81
 1932.8 
 2032.4 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1874   48.14
 1800.6 
 1783.4 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1553.3   46.82
 1493.1 
 1461 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  2098.2   79.76
 2040.6 
 2198.3 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  2234.6   118.65
 2160.1 
 2002.3 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  1897.8   93.29
 1935.3 
 2074.8 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  1749.6   42.5
 1731.4 
 1668.6 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  787   26.22
 834.7 
 829.6 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  594.8   41.57
 674.7 
 615 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  551.3   9.76
 548.3 
 533.1 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays