TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
  
 

AGI number: At5g61750
TIGR annotation:cupin family protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  103.5   3.47
 97.4 
 103.2 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  126.2   5.59
 115.1  
 121.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  115   5.48
 106.2 
 116.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  112.7   10.61
 132.7 
 116.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  104.3   5.88
 99.9 
 92.6 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  97.4   10.61
 100.4 
 117.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  76.1   13.28
 101.5 
 82.1 
 1.03 Root (ATGE_94)  83.1   6.66
 69.7 
 76.2 
 1.03 Root (ATGE_95)  86.4   7.57
 89.5 
 100.8 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  107.8   5.78
 111.6 
 100.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  89.2   6.54
 76.1 
 83.5 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  74.9   11.71
 90.2 
 97.9 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  87.9   7.7
 102 
 89.5 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  76.2   4.42
 83.6 
 84.1 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  91.1   5.37
 88.2 
 98.6 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  88.2   6.45
 88.2 
 99.4 
 3.20 Root (ATGE_93)  93.8   3.83
 88 
 86.5 
 3.20 Root (ATGE_98)  93   2.19
 93 
 89.2 
 3.20 Root (ATGE_99)  91.2   6.12
 82.6 
 94.5 
 3.20 Roots (ATGE_9)  107.4   8.34
 90.9 
 96.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  111.3   3.21
 105.1 
 109.5 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  97.8   8.44
 106 
 114.7 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  99.7   7.63
 100.4 
 113.3 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  87.1   8.68
 98.7 
 104.2 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  88.1   5.58
 94.2 
 99.3 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  95.3   2.08
 96.4 
 99.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  96.8   2.09
 99.4 
 101 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  93.7   1.56
 94.1 
 96.6 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  108.5   10.66
 103.4 
 88 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  100.6   7.21
 113.3 
 101.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  110.4   10.82
 90.1 
 93.8 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  91.7   3.13
 97.9 
 94 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  73.5   1.8
 71.8 
 69.9 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  76.5   5.16
 66.2 
 70.8 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  81.5   3.77
 86.2 
 88.9 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  74.6   4.73
 82.7 
 82.9 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  86.3   6.29
 75.9 
 87.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  83.5   6.31
 96.1 
 88.9 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  81   5.11
 71.7 
 80.1 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  81.9   6.12
 78.6 
 70 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  85.1   3.23
 90.9 
 85.5 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  77.1   8.65
 66.7 
 83.8 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  82.7   4.9
 92.5 
 87.5 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  103.3   5.07
 95.5 
 105 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  75.7   7.14
 80 
 66 
 6.00 Flower (ATGE_92)  74.3   2.89
 77.9 
 80 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  149   14.31
 162.8 
 177.6 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  87.7   7.49
 100.3 
 87 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  66.2   11.6
 76.7 
 89.3 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  108.6   12.24
 85.3 
 103.5 
 6.50 Stem (ATGE_27)  152.4   1.65
 152.9 
 155.5 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  71   10.94
 85.8 
 92.4 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  84.5   6.01
 72.5 
 77.9 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  91.8   8.68
 102.2 
 85 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  98.2   6.44
 96.3 
 108.3 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  111.8   9.56
 93.1 
 105.9 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  104.6   7.19
 98.1 
 90.2 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  115.4   8.76
 108.1 
 125.5 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays