TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g61820
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  790.4   11.55
 813.1 
 797.7 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  616.7   27.38
 608.3  
 565.6 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  1135.2   7.63
 1125.4 
 1120.2 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  360.3   16.62
 343.5 
 327 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  124.7   7.61
 138.5 
 137.2 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  125   10.8
 114.9 
 136.5 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  743.5   41.56
 661.8 
 689.4 
 1.03 Root (ATGE_94)  3366.1   97.73
 3187.5 
 3207.9 
 1.03 Root (ATGE_95)  2643.1   91.3
 2693.2 
 2820.2 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  261.7   1.2
 264 
 263.3 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  1056.7   25.48
 1015.9 
 1062.8 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2294.2   83.73
 2131.1 
 2180 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2008.1   51.93
 1993.1 
 2089.6 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  368   10.06
 387.5 
 382.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  158.7   3.82
 165.5 
 165.2 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  305.6   23.84
 350.1 
 313 
 3.20 Root (ATGE_93)  2798.1   32.37
 2802.2 
 2744.2 
 3.20 Root (ATGE_98)  4185.2   435.46
 3651.5 
 4514.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  3537.8   78.38
 3687.5 
 3653.1 
 3.20 Roots (ATGE_9)  956.5   44.36
 916.7 
 867.9 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  496.8   6.72
 483.3 
 489.3 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  1125.2   46.24
 1146.1 
 1213.6 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  938   24.69
 942.1 
 897.4 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  1247.6   34.29
 1251.5 
 1308.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  2179.1   140.77
 2307.9 
 2026.7 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  1402.1   134.8
 1147.4 
 1351.4 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  1042.5   58.3
 1073.7 
 960.8 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  770.1   11.29
 751.5 
 749.8 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  558.6   28.09
 511.4 
 508.7 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  290.4   13.87
 306.1 
 318.1 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2310.6   46.03
 2320.6 
 2236.3 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  3816   74.9
 3672.3 
 3707.8 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  602.6   26.83
 621.6 
 568.6 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  1740.9   94.4
 1588.1 
 1760.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2145.2   118.71
 2381.2 
 2241.4 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  7899.4   225.08
 8292.9 
 7906.8 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  586.5   21.4
 545.2 
 556.2 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  2439.8   148.46
 2545.5 
 2252.3 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  494.7   14.56
 484.2 
 512.9 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  3930.3   186.43
 3822.3 
 3567.3 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  826.8   31.92
 769.7 
 823 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  9855   179.87
 9831.7 
 9532.4 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  5751.5   372.19
 5055.4 
 5631.9 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  3351   405.24
 3987.9 
 4103.5 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  1190   19.81
 1225.3 
 1223.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  752.4   38
 678.3 
 730.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  781.9   36.66
 770 
 713.3 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  3386.4   195.5
 3046.8 
 3384.3 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  6383   380.45
 6658.9 
 5906.8 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  1486.2   38.64
 1504.5 
 1430.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  1221.6   22.44
 1231.1 
 1264.3 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  4668.8   497.26
 3763.3 
 3859.9 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  3934.4   251.45
 3543.4 
 3465 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  515.8   44.45
 585.8 
 598.2 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  630.8   42.05
 669.8 
 714.8 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  1000.6   80.28
 1081 
 1161.2 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  1348   35.25
 1325.8 
 1394.8 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  1614.1   74.87
 1541.3 
 1464.3 

Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays