TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At5g63310
TIGR annotation:nucleotide diphosphate kinase II, chloroplast (NDPK2)
Data resource: AtGenExpress
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 1.02 Roots (ATGE_3)  658.7   30.77
 614.8 
 599.4 
 1.02 Hypocotyl (ATGE_2)  1664.2   40.07
 1590.6  
 1599.9 
 1.02 Cotyledon (ATGE_1)  3070.4   88.63
 3094.6 
 2930.4 
 1.02 Leaves 1+2 (ATGE_5)  4782.7   105.17
 4588.9 
 4614.9 
 1.02 Shoot apex (ATGE_4)  5602.2   54.11
 5522.5 
 5625.8 
 1.02 Shoot apex (ATGE_6)  4351.4   27.31
 4406 
 4379.1 
 1.02 Seedling, green parts (ATGE_7)  4494.6   80.87
 4520.9 
 4369.5 
 1.03 Root (ATGE_94)  397   36.19
 444.8 
 468 
 1.03 Root (ATGE_95)  489.3   5.96
 477.4 
 483.5 
 1.03 Rosette leaf (ATGE_10)  5330.1   169.84
 5333.3 
 5037.5 
 1.03 Rosette, 7d (ATGE_87)  3484.6   133.96
 3611.8 
 3752.4 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_96)  2703.3   45.97
 2611.5 
 2653.3 
 1.03 Seedling, green parts (ATGE_97)  2883.5   131.68
 2684.3 
 2933.1 
 1.06 Rosette, 14d (ATGE_89)  4491.4   107.23
 4697.3 
 4542.3 
 1.08 Shoot apex (ATGE_8)  2313.3   141.57
 2378.7 
 2107.4 
 1.10 Rosette, 21d (ATGE_90)  4861.8   12.68
 4837.8 
 4856.9 
 3.20 Root (ATGE_93)  460.9   18.66
 488.7 
 453.3 
 3.20 Root (ATGE_98)  371.8   10.05
 361.3 
 381.4 
 3.20 Root (ATGE_99)  328   2.55
 329.5 
 333 
 3.20 Roots (ATGE_9)  492.1   13.59
 514.8 
 516.4 
 3.20 Leaf 7, petiol (ATGE_19)  3650   162.1
 3873.3 
 3965.2 
 3.20 Leaf 7, distal half (ATGE_21)  3211.8   86.8
 3240.7 
 3078 
 3.20 Leaf 7, proximal half (ATGE_20)  4080.4   37.99
 4154.7 
 4103.7 
 3.20 Leaf (ATGE_91)  3150.1   64.81
 3048.4 
 3168.8 
 3.20 Rosette leaf #2 (ATGE_12)  1908.1   58.16
 1796.1 
 1879.2 
 3.20 Rosette leaf #4 (ATGE_13)  2452.5   11.5
 2448.5 
 2430.9 
 3.20 Rosette leaf #6 (ATGE_14)  3025.8   75.21
 3172.7 
 3071.6 
 3.20 Rosette leaf #8 (ATGE_15)  4132.9   96.83
 4080.2 
 4267.9 
 3.20 Rosette leaf #10 (ATGE_16)  4352.4   111.63
 4368.9 
 4167.9 
 3.20 Rosette leaf #12 (ATGE_17)  4672.2   144.69
 4896.2 
 4625.6 
 3.20 Rosette (ATGE_100)  2031.4   57.8
 2146.5 
 2079.7 
 3.20 Rosette (ATGE_101)  2212.3   90.62
 2370.4 
 2214.5 
 5.10 Flower stage 9 (ATGE_31)  2503   520.46
 3329.2 
 3464.4 
 5.10 Flower stage 10/11 (ATGE_32)  3479.5   168.12
 3143.8 
 3328.6 
 5.10 Flower stage 12 (ATGE_33)  2294.9   90.19
 2371.2 
 2474.6 
 5.10 Flower stage 12, sepal (ATGE_34)  2294.6   129.69
 2548 
 2373.4 
 5.10 Flower stage 12, petal (ATGE_35)  1860.4   21.2
 1822.1 
 1856.9 
 5.10 Flower stage 12, stamen (ATGE_36)  750.1   7.43
 740.4 
 735.6 
 5.10 Flower stage 12, carpel (ATGE_37)  1541.5   33.96
 1545 
 1602 
 6.00 Flower stage 15 (ATGE_39)  1306.5   5.42
 1317 
 1313.9 
 6.00 Flower stage 15, pedicel (ATGE_40)  3830.6   68.55
 3884.5 
 3748.4 
 6.00 Flower stage 15, sepal (ATGE_41)  485.1   12.2
 480.2 
 462 
 6.00 Flower stage 15, petal (ATGE_42)  630.6   9.07
 622.1 
 640.3 
 6.00 Flower stage 15, stamen (ATGE_43)  536.1   20.13
 502 
 537.6 
 6.00 Flower stage 15, carpel (ATGE_45)  2741.1   46.93
 2648.5 
 2681.2 
 6.00 Flower (ATGE_92)  2520.6   156.66
 2744.8 
 2822.2 
 6.00 Mature pollen (ATGE_73)  145.5   9.62
 133.5 
 126.4 
 6.30 Cauline leaf (ATGE_26)  941   52.21
 841.1 
 917.4 
 6.30 Senescing leaf (ATGE_25)  369   22.1
 378.2 
 336.2 
 6.30 Silique stage 3 (ATGE_76)  3914.3   149.02
 3764.8 
 3616.3 
 6.50 Stem (ATGE_27)  771.7   35.75
 742.9 
 814 
 6.50 Silique stage 4 (ATGE_77)  1547.1   15.83
 1515.5 
 1533.6 
 6.90 Silique stage 5 (ATGE_78)  1267.5   21.77
 1308.8 
 1276.1 
 6.90 Seed stage 6 (ATGE_79)  821.1   20.99
 863 
 839.4 
 6.90 Seed stage 7 (ATGE_81)  547.7   33.13
 562.6 
 611.1 
 6.90 Seed stage 8 (ATGE_82)  236.8   11.4
 254 
 258.4 
 8.00 Seed stage 9 (ATGE_83)  144.1   9.98
 163.9 
 155.5 
 8.00 Seed stage 10 (ATGE_84)  158.3   7.81
 171.9 
 158.4 

Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: AtGenExpress
     change to: NASCArrays