TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g02820
TIGR annotation:late embryogenesis abundant 3 family protein / LEA3 family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  130.3   35.64
 198.7 
 147.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  181.3   25.41
 150.6 
 211.5 
 191.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  218.1   23.88
 188.8 
 162.4 
 175.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  204.6   19.66
 180.3 
 217.9 
 225 
 0.70 Seedling (SL01)  226.6   7.89
 217.7 
 233.4 
 0.70 Seedling (SL02)  349.1   48.16
 343.2 
 262.9 
 0.70 Seedling (SL10)  128   6.64
 119.1 
 115 
 0.70 Seedling (SL12)  144.4   35.54
 146.4 
 206.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  142.6   14.66
 125.3 
 154.5 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  125.5   21.18
 110.8 
 152.6 
 1.00 Seedling (SL07)  848.6   237.59
 512.6 
 1.00 Seedling (SL09)  275.6   10.84
 271.1 
 255 
 1.00 Seedling (SL11)  1284.3   607.15
 1013.1 
 128.9 
 101 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  115.3   10.14
 129.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  176.5   10.32
 185.4 
 164.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  310.6   24.69
 308 
 352 
 1.02 Seedling (SL08)  182.4   26.18
 145.4 
 1.02 Roots (RT01)  129.7   26.97
 167.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  222.5   9.19
 209.4 
 204.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  243.7   85.19
 356.7 
 189.8 
 1.05 Rosette (LF11)  1769.3   651.18
 2827.3 
 2956.1 
 1.14 Rosette (LF12)  225.6   445.3
 1083.4 
 447 
 1.14 Rosette (LF13)  518.3   24.03
 484.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  836.6   28.36
 814.4 
 780.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  3818   237.38
 4094.3 
 4290.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  4212.7   93.9
 4032.9 
 4169.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  315.3   5.2
 317.6 
 307.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  242.3   134.73
 299 
 498.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  375   238.63
 826.4 
 734.9 
 3.90 Rosette (SH01)  242.1   16.47
 263.8 
 274.3 
 3.90 Roots (RT04)  209.2   15.82
 239.9 
 231.1 
 3.90 Roots (RT05)  222.5   33.76
 233 
 285.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  318.9   8.67
 310 
 301.2 
 300.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  174.3   101.56
 317.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  182.1   53.7
 87.4 
 178.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  235.5   37.89
 290.5 
 217.9 
 5.10 Roots (RT02)  189.4   28.82
 148.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  462.3   48.94
 393.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  324   24.79
 359.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  213.3   20.15
 241.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  282.8   38.09
 336.7 
 6.00 Leaf (LF08)  478.2   229.5
 895.3 
 520.8 
 6.00 Leaf (LF16)  581.6   55.44
 673.7 
 681.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  304.1   96.5
 167.6 
 6.10 Leaf (LF10)  427.8   51.48
 390.3 
 326 
 6.10 Stem base (ST01)  281.3   9.51
 294.8 
 6.10 Stem top (ST02)  147.8   36.79
 199.8 
 6.10 Flower, open (FL01)  526.7   885.38
 1778.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  149.7   68.98
 247.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  281.5   97.43
 382.4 
 187.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  233.1   88.74
 117.5 
 291.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  565   146.69
 321.8 
 301.3 
 Suspension cell culture (SU01)  205.8   25.9
 160.7 
 161.1 
 Suspension cell culture (SU02)  161.6   34.47
 210.4 
 Xylem (XL01)  139.5   11.17
 118.8 
 121.8 
 Cork (CR01)  146.3   5.99
 139.9 
 134.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  226.4   52.07
 133.3 
 220.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  165.8   9.71
 167.3 
 183.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  145.1   70.08
 273.3 
 258.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  169   28.33
 224.6 
 187.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  91.9   2.46
 95.5 
 90.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  78.4   64.81
 199.5 
 99 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  203.3   32.98
 168.5 
 137.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  187.6   35.4
 117.5 
 144.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  129.4   24.8
 139 
 176.4 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress