TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g11360
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  616.5   101.79
 820 
 724.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  1697.9   33.75
 1633.6 
 1673.5 
 1626.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1662.2   55.59
 1725.4 
 1794.3 
 1700.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  654   28.36
 646 
 628 
 695 
 0.70 Seedling (SL01)  641.6   24.33
 642.1 
 599.7 
 0.70 Seedling (SL02)  701.7   19.29
 698.7 
 666.9 
 0.70 Seedling (SL10)  631   31.9
 618.8 
 679.2 
 0.70 Seedling (SL12)  886.8   85.88
 996.8 
 827.6 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1000   54.55
 1082.4 
 1103.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  754   14.31
 742.7 
 771.1 
 1.00 Seedling (SL07)  615.3   15.9
 592.8 
 1.00 Seedling (SL09)  965.3   51.81
 1057 
 969.4 
 1.00 Seedling (SL11)  588.6   175.76
 662.4 
 990.2 
 706 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1048.3   35.55
 998 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  569.8   105.74
 781.2 
 671.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  835.4   39.81
 755.9 
 792.8 
 1.02 Seedling (SL08)  827   105.91
 976.8 
 1.02 Roots (RT01)  728.3   10.69
 713.2 
 1.02 Lateral roots (RH01)  666.1   26.56
 675.1 
 715.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  712.1   104.77
 861.6 
 914 
 1.05 Rosette (LF11)  391.6   15.72
 403.8 
 422.8 
 1.14 Rosette (LF12)  659.4   64.3
 562.2 
 683.8 
 1.14 Rosette (LF13)  560.7   148.7
 771 
 3.20 Whole plant (WP05)  741.3   42.4
 658.5 
 684.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  344.7   18.39
 312.5 
 313.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  309.1   23.72
 348.8 
 306.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  741.5   135.92
 519.6 
 494.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  555.7   44.13
 639.6 
 573.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  467.3   111.11
 684 
 618.3 
 3.90 Rosette (SH01)  607.1   67.17
 667.5 
 741.2 
 3.90 Roots (RT04)  950.8   70.59
 973.5 
 1082.8 
 3.90 Roots (RT05)  889.9   33.02
 868.3 
 825.1 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  496.5   34.32
 497.8 
 426.1 
 488.3 
 5.10 Flower, buds (FB01)  588.4   29.78
 546.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  597.4   187.42
 965 
 717.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  686.5   36.87
 760 
 728.3 
 5.10 Roots (RT02)  801.1   51.61
 874.1 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  511.4   80.01
 398.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  584   75.4
 477.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  358.8   30.26
 316 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  278.4   5.49
 270.7 
 6.00 Leaf (LF08)  642.6   86.19
 607.5 
 771.2 
 6.00 Leaf (LF16)  1029.8   61.33
 1063.5 
 1148.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  416.7   134.57
 607 
 6.10 Leaf (LF10)  547.1   78.17
 653.4 
 699.5 
 6.10 Stem base (ST01)  930.2   89.59
 803.5 
 6.10 Stem top (ST02)  704.6   50.12
 633.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  491   8.62
 478.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  639.5   85.54
 518.5 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  424.2   107.74
 534.6 
 639.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1604.2   277.52
 1243.9 
 1058.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  465.9   34.53
 460.6 
 522.9 
 Suspension cell culture (SU01)  706.4   124.81
 935.9 
 906.1 
 Suspension cell culture (SU02)  725.7   89.1
 599.7 
 Xylem (XL01)  1187.2   26.76
 1151 
 1134.9 
 Cork (CR01)  981.9   30.53
 1037.7 
 1031.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  695.5   142.81
 550.3 
 409.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  522   156.63
 675.3 
 835.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  557.3   1083.22
 376.6 
 2336.6 
 Heart embryo, roots (EHR1)  519.1   3158.51
 5938.4 
 417.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1298   200.92
 922.1 
 987 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1129.9   621.99
 162.2 
 1323.1 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  416.3   484.37
 1202.4 
 319 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  140   372.43
 862.9 
 656.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  168.2   152.87
 473.7 
 332.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress