TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g11960
TIGR annotation:early-responsive to dehydration protein-related / ERD protein-related
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  122.7   34.74
 172.5 
 105.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  95.7   23.12
 144.4 
 103.4 
 97 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  102   5.36
 111.9 
 101.7 
 100.2 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  140.3   10.37
 121 
 125.8 
 116.3 
 0.70 Seedling (SL01)  159.1   6.02
 148.1 
 149.3 
 0.70 Seedling (SL02)  88.7   5.72
 93 
 81.7 
 0.70 Seedling (SL10)  211.3   8.27
 196.1 
 209.4 
 0.70 Seedling (SL12)  177.3   11.79
 200.8 
 190.7 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  247.5   195.3
 567.2 
 601.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  216   15.25
 234 
 203.6 
 1.00 Seedling (SL07)  164.9   9.3
 178.1 
 1.00 Seedling (SL09)  194.9   17.34
 226.1 
 223.6 
 1.00 Seedling (SL11)  204.4   11.14
 210.9 
 186.4 
 192.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  274.1   91.75
 403.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  156.9   16.54
 131.3 
 126 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  138.9   5.71
 146.9 
 135.9 
 1.02 Seedling (SL08)  197.8   5.45
 205.5 
 1.02 Roots (RT01)  899.3   230.66
 573.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  157.6   35.3
 169.8 
 223.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  139.8   48.7
 236.1 
 200.6 
 1.05 Rosette (LF11)  113.2   6.86
 105.4 
 99.5 
 1.14 Rosette (LF12)  189.9   59.22
 298.5 
 203.2 
 1.14 Rosette (LF13)  129.5   6.07
 138.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  239.7   6.27
 233.4 
 245.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  122.1   9.7
 117.3 
 136 
 3.70 Adult leaf (LF02)  171.1   23.72
 124.3 
 140.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  97.2   3.07
 97.2 
 91.9 
 3.90 Adult leaf (LF03)  170.1   313.21
 626 
 770.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  148.4   634.78
 1209.9 
 1282.2 
 3.90 Rosette (SH01)  211.2   38.83
 156.7 
 136 
 3.90 Roots (RT04)  168.4   9.39
 151.4 
 166.8 
 3.90 Roots (RT05)  175.7   5.73
 175.4 
 185.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  84.5   3.51
 91.5 
 90.6 
 92.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  365.6   84.85
 245.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  186.4   36.63
 236 
 164.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  192.1   22.08
 186.7 
 151.4 
 5.10 Roots (RT02)  371.4   48.44
 439.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  96.4   8.09
 107.9 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  91.9   4.63
 98.5 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  81.7   10.28
 96.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  96   9.53
 109.4 
 6.00 Leaf (LF08)  198.2   17.95
 194.2 
 227.1 
 6.00 Leaf (LF16)  335.7   44.24
 259.6 
 258.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  198.1   37.53
 145 
 6.10 Leaf (LF10)  110   15.37
 140.7 
 123.8 
 6.10 Stem base (ST01)  263.7   57.42
 182.5 
 6.10 Stem top (ST02)  164   5.66
 172 
 6.10 Flower, open (FL01)  231.1   46.47
 165.4 
 6.30 Silique, young (FS01)  236.6   45.71
 172 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  324   39.75
 245.2 
 275.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  130.5   18.6
 116.3 
 93.6 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  193.9   29.42
 227.8 
 169.2 
 Suspension cell culture (SU01)  144.7   6.28
 135.3 
 132.8 
 Suspension cell culture (SU02)  187.6   2.82
 191.6 
 Xylem (XL01)  166.9   9.55
 148.8 
 152.6 
 Cork (CR01)  204.4   21.78
 177 
 220.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  159.1   132.42
 375.7 
 135.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  126.8   57.77
 115.4 
 220.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  634.8   302.6
 90.8 
 133 
 Heart embryo, roots (EHR1)  717.5   338.21
 129.7 
 133.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  454.6   210.62
 538.3 
 138.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  133.3   144.97
 292 
 422.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  344.2   20.94
 313.8 
 354 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  340.6   66.15
 208.4 
 269.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  398.7   135.91
 267.7 
 127 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress