TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g23230
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  558.7   87.96
 460.5 
 383.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  395.7   59.7
 505.6 
 371.7 
 398.7 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  452   28.7
 448.2 
 392.8 
 411.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  369.3   13.46
 395.5 
 398.6 
 393.8 
 0.70 Seedling (SL01)  258.8   25.68
 289 
 309.9 
 0.70 Seedling (SL02)  217.9   8.1
 213.9 
 202.3 
 0.70 Seedling (SL10)  230.3   11.92
 230.1 
 250.8 
 0.70 Seedling (SL12)  89.8   30.51
 146.7 
 137.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  558.2   6.42
 562 
 549.5 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  480.1   3.27
 475.3 
 481.5 
 1.00 Seedling (SL07)  298.7   5.31
 306.2 
 1.00 Seedling (SL09)  207.4   12.38
 226.2 
 230.7 
 1.00 Seedling (SL11)  271   23.44
 250.1 
 228.5 
 218.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  371.2   18.37
 345.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  320.7   32.72
 282.2 
 255.6 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  171.2   22.7
 163.5 
 206.1 
 1.02 Seedling (SL08)  311.5   35.18
 261.8 
 1.02 Roots (RT01)  253   46.45
 318.7 
 1.02 Lateral roots (RH01)  263.4   27.61
 295.9 
 318.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  273.8   22.41
 233.5 
 236.7 
 1.05 Rosette (LF11)  265.2   7.93
 256.6 
 272.4 
 1.14 Rosette (LF12)  319.6   25.11
 368.2 
 333.2 
 1.14 Rosette (LF13)  274.3   11.98
 257.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  170.2   18.69
 202.1 
 169.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  257.6   10.2
 277.4 
 271.8 
 3.70 Adult leaf (LF02)  265.9   10.97
 287.8 
 275.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  345   29.61
 291.8 
 296 
 3.90 Adult leaf (LF03)  396.8   54.4
 307.9 
 298.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  340   20.75
 301.1 
 308.2 
 3.90 Rosette (SH01)  310.6   27.18
 338.2 
 283.9 
 3.90 Roots (RT04)  278.8   28.62
 310.3 
 335.9 
 3.90 Roots (RT05)  259.1   4.12
 266.7 
 260.1 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  226   17.82
 253 
 252.8 
 218.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  340.2   16.02
 362.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  345.3   14.03
 324.2 
 318.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  413.7   69.06
 328.9 
 276.9 
 5.10 Roots (RT02)  389.2   76.14
 281.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  446.2   32.25
 400.6 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  550.4   0.29
 550.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  519.9   31.4
 475.5 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  325.2   12.17
 308 
 6.00 Leaf (LF08)  335.6   21.63
 331.3 
 296.2 
 6.00 Leaf (LF16)  282.7   1.89
 279.2 
 282.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  320   8.45
 308.1 
 6.10 Leaf (LF10)  238   29.06
 266.7 
 296.1 
 6.10 Stem base (ST01)  477.4   2.3
 474.1 
 6.10 Stem top (ST02)  369.6   33.98
 417.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  352.2   6.45
 343.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  336.5   15.9
 314 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  400.5   30.18
 345.5 
 394.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  417.6   54.06
 311.1 
 347.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  297   55.67
 380.5 
 402.5 
 Suspension cell culture (SU01)  464.5   50.02
 535 
 561.2 
 Suspension cell culture (SU02)  432   44.64
 495.2 
 Xylem (XL01)  612.5   44.21
 525 
 557.8 
 Cork (CR01)  487   41.85
 443.9 
 527.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  527.7   105.68
 361.2 
 331.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  366.1   49.15
 281.9 
 280 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  264.1   67.93
 382.3 
 265.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  431.8   94.48
 260.7 
 276.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  344.6   51.55
 249 
 330.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  191.3   98.06
 375.9 
 226.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  257.3   27.34
 307.6 
 263.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  485   142.09
 280.7 
 211.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  516.1   232.56
 666.3 
 210 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress