TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g34370
TIGR annotation:zinc finger (C2H2 type) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1611.9   130.37
 1801.5 
 1551.7 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  5117.8   70.4
 5278.3 
 5231.5 
 5249.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  4476.6   222.98
 4506.2 
 4167.4 
 4059.4 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1402.1   72.99
 1557.9 
 1542.1 
 1541.7 
 0.70 Seedling (SL01)  1134.3   11.61
 1111.4 
 1126.6 
 0.70 Seedling (SL02)  1304.3   52.19
 1270.4 
 1201.9 
 0.70 Seedling (SL10)  1148.1   57.99
 1251.8 
 1244.8 
 0.70 Seedling (SL12)  1116.5   18.51
 1130.8 
 1094.1 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  3002.7   177.43
 2737.9 
 2665.6 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1797.3   39.3
 1873.9 
 1820.4 
 1.00 Seedling (SL07)  1587.1   70.56
 1686.9 
 1.00 Seedling (SL09)  1797.1   46.15
 1881.6 
 1807.1 
 1.00 Seedling (SL11)  1523.1   227.19
 1576.9 
 1939 
 1415.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1872.9   35.39
 1822.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1151.6   22.76
 1155.2 
 1192.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1875   47.25
 1930.5 
 1836.5 
 1.02 Seedling (SL08)  2307.7   160.73
 2080.4 
 1.02 Roots (RT01)  1925.3   255.56
 2286.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1951   35.45
 1885.1 
 1895.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1627.3   85.49
 1796.1 
 1687.8 
 1.05 Rosette (LF11)  847.3   43.29
 773.3 
 771.3 
 1.14 Rosette (LF12)  1346.3   72
 1270.9 
 1414.8 
 1.14 Rosette (LF13)  1196.8   157.56
 1419.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  952   24.31
 949.3 
 908.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  816.3   33.92
 763.5 
 753 
 3.70 Adult leaf (LF02)  801.5   24.29
 753.8 
 769.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1005.9   109.37
 801.6 
 836.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1454.1   340.04
 2036.3 
 2049.6 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1239.1   466.15
 2108.5 
 1965.4 
 3.90 Rosette (SH01)  1357.4   248.28
 1850.5 
 1553.2 
 3.90 Roots (RT04)  2234.1   595.42
 3421.8 
 2902.3 
 3.90 Roots (RT05)  1891.9   196.1
 1915.4 
 2242.7 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  741.8   61.39
 881.4 
 812.6 
 857.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  1134   80.48
 1020.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1392.6   89.86
 1361.4 
 1223.7 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1353.2   160.81
 1034.7 
 1155 
 5.10 Roots (RT02)  2231.1   16.65
 2207.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1143.5   51.31
 1216.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1024.9   101.24
 1168.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  558.4   20.21
 529.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  445   2.52
 441.4 
 6.00 Leaf (LF08)  1261   49.19
 1238.8 
 1166.9 
 6.00 Leaf (LF16)  1615.8   54.86
 1513.5 
 1599.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1001.2   129.95
 1185 
 6.10 Leaf (LF10)  1353.1   117.19
 1126.5 
 1188.1 
 6.10 Stem base (ST01)  2317.6   287.86
 1910.5 
 6.10 Stem top (ST02)  1132.9   33.74
 1085.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  1058.7   149.59
 847.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  1043.1   28.12
 1003.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1408.2   33.5
 1424.6 
 1472.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  3852   729.57
 2549 
 2631.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1506.8   63.51
 1616.2 
 1505.7 
 Suspension cell culture (SU01)  2764.2   275.83
 2319.6 
 2259.1 
 Suspension cell culture (SU02)  3369.4   73.47
 3473.3 
 Xylem (XL01)  3323.6   194.64
 2964.9 
 3013.3 
 Cork (CR01)  3090   294.65
 2609.4 
 2554.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1456.7   222.57
 1834.9 
 1442.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1217.8   484.83
 1769.8 
 803.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1520.6   412.74
 1302.8 
 722.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  968.4   2245.58
 3222.4 
 5459.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  1812.9   221.98
 1396 
 1472.4 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  2166.6   743.94
 755.5 
 1869.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  456.9   968.99
 2134.3 
 455 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  298.4   1732.08
 1142.9 
 3630.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  870.2   1199.37
 2663.1 
 386.6 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress