TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g50960
TIGR annotation:gibberellin 20-oxidase-related
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  44.2   9.32
 47.7 
 61.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  44.1   6.15
 43.5 
 55.8 
 52.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  52.3   4.87
 43 
 42.8 
 41.9 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  51.9   1.73
 47.9 
 50.4 
 48.8 
 0.70 Seedling (SL01)  54.8   1.99
 58.8 
 57 
 0.70 Seedling (SL02)  47.8   1.92
 51.6 
 49.2 
 0.70 Seedling (SL10)  37.3   2.09
 35.1 
 33.2 
 0.70 Seedling (SL12)  42   0.62
 40.9 
 40.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  53.8   0.44
 53 
 53.9 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  71.2   2.68
 73.8 
 76.6 
 1.00 Seedling (SL07)  48.9   7.45
 59.4 
 1.00 Seedling (SL09)  24.6   3.87
 31.1 
 24.2 
 1.00 Seedling (SL11)  40.3   7.75
 45 
 29.2 
 30.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  92.7   5.8
 84.5 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  64.4   1.63
 61.3 
 62.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  72.8   3.28
 66.8 
 72.1 
 1.02 Seedling (SL08)  51.5   0.34
 52 
 1.02 Roots (RT01)  40.3   5.68
 48.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  53.1   4.33
 58.6 
 50.1 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  55.1   9.05
 54.9 
 39.3 
 1.05 Rosette (LF11)  40.9   7.37
 50.3 
 55.5 
 1.14 Rosette (LF12)  45.3   6.91
 46 
 57.6 
 1.14 Rosette (LF13)  49.3   3.38
 44.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  43.3   7.18
 43.9 
 31.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  51.4   2.87
 50 
 55.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  60.9   3.17
 55.3 
 55.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  56.1   9.54
 48.4 
 37.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  55.9   6.94
 54.1 
 43.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  62   10.5
 41 
 52.8 
 3.90 Rosette (SH01)  50.4   2.71
 55.5 
 54.6 
 3.90 Roots (RT04)  50.6   3.94
 48.5 
 43 
 3.90 Roots (RT05)  39.4   4.85
 48.9 
 45.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  59.5   5.96
 47.1 
 49.4 
 46.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  37.5   1.6
 35.2 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  50.5   2.88
 48.9 
 44.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  57.4   6.21
 46 
 47.5 
 5.10 Roots (RT02)  45.7   2.13
 42.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  78.2   4.15
 84.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  57.4   8.67
 69.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  87.9   4.43
 94.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  82   24.17
 116.2 
 6.00 Leaf (LF08)  57.2   3.15
 62.1 
 56.3 
 6.00 Leaf (LF16)  32.9   2.19
 28.8 
 29.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  51.2   2.61
 54.9 
 6.10 Leaf (LF10)  47.5   3.24
 46.3 
 52.4 
 6.10 Stem base (ST01)  49.5   10.75
 64.7 
 6.10 Stem top (ST02)  54.9   4.49
 48.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  47.3   2.11
 50.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  41.8   3.2
 37.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  46   5.88
 37.9 
 49.4 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  48.2   8.4
 49.2 
 63.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  47.7   1.16
 50 
 48.6 
 Suspension cell culture (SU01)  97.7   15.86
 120 
 128.4 
 Suspension cell culture (SU02)  139.5   40.61
 82 
 Xylem (XL01)  60.1   34.4
 51.3 
 114.8 
 Cork (CR01)  108.1   4.87
 105.6 
 115 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  181.7   23.99
 226.4 
 188.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  218.6   22.72
 181.5 
 177.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  158.4   26.85
 123.6 
 176.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  119.1   36.08
 170.3 
 188.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  106.6   5.57
 116.8 
 115.6 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  184.8   62.92
 59.7 
 110.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  180.8   25.95
 198.2 
 147.2 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  100.6   63.37
 70.2 
 192 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  189.2   85.01
 303.7 
 355.3 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress