TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g52000
TIGR annotation:jacalin lectin family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  124.5   90.55
 253 
 78.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  28   5.24
 24.6 
 34.8 
 35.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  28.1   2
 29.4 
 32.3 
 28 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  108.7   25.02
 60.1 
 116.7 
 94.5 
 0.70 Seedling (SL01)  63.4   2.31
 62.2 
 66.7 
 0.70 Seedling (SL02)  104.1   31.15
 107.1 
 159.5 
 0.70 Seedling (SL10)  333.7   30.5
 278.9 
 329.4 
 0.70 Seedling (SL12)  271.6   24.34
 256.6 
 304.2 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  59   5.41
 57.2 
 67.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  451.9   46.12
 426.7 
 362.5 
 1.00 Seedling (SL07)  527.4   46.65
 461.5 
 1.00 Seedling (SL09)  430.2   75.89
 441.9 
 567.1 
 1.00 Seedling (SL11)  590.9   84.77
 442.1 
 407.2 
 422.2 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  169   5.97
 160.5 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1037.9   167.07
 731.4 
 769.3 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  516.6   95.28
 704.4 
 582.4 
 1.02 Seedling (SL08)  471   33.37
 423.8 
 1.02 Roots (RT01)  113.5   31.97
 68.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  56.1   3.41
 62.9 
 60.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  160.3   157.66
 451.6 
 410.4 
 1.05 Rosette (LF11)  529.2   28.44
 553.3 
 585.9 
 1.14 Rosette (LF12)  304.5   66.75
 374.6 
 241.2 
 1.14 Rosette (LF13)  1004.6   372.12
 478.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  681.8   18.53
 689.1 
 716.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1422.5   68.09
 1404.6 
 1296.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1417.5   176.01
 1102.9 
 1397 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  592.5   214.05
 629.5 
 241.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  419.2   1076.21
 1858.6 
 2524.9 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1288.1   129.72
 1197.8 
 1032.3 
 3.90 Rosette (SH01)  2304.6   683.49
 962.7 
 1407.6 
 3.90 Roots (RT04)  48.7   7.73
 33.5 
 38.9 
 3.90 Roots (RT05)  70.7   16.08
 54.9 
 38.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  728.7   62.71
 743.6 
 836.8 
 688.7 
 5.10 Flower, buds (FB01)  292.5   6.85
 282.8 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  492.9   182.07
 134.9 
 371.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  727.1   292.33
 257.3 
 190.9 
 5.10 Roots (RT02)  43.5   0.03
 43.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  58.8   0.58
 58 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  47.5   1.01
 46.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  39.9   7.21
 50.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  52.1   1.95
 49.4 
 6.00 Leaf (LF08)  2064.3   547.64
 1463.8 
 970.7 
 6.00 Leaf (LF16)  505.4   297.89
 1099.9 
 836.9 
 6.00 Inflorescence (IN01)  308.3   342.66
 792.9 
 6.10 Leaf (LF10)  1016.3   530.64
 1997.1 
 1857.8 
 6.10 Stem base (ST01)  81.6   46.76
 147.8 
 6.10 Stem top (ST02)  198.9   51.15
 126.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  407.5   182.11
 665.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  220.6   13.53
 239.7 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  24.2   8.76
 36.7 
 41.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  33.6   3.83
 41 
 39.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  28.8   6.54
 41.9 
 35.9 
 Suspension cell culture (SU01)  48.8   7.2
 34.5 
 42.9 
 Suspension cell culture (SU02)  50.3   3.37
 45.6 
 Xylem (XL01)  40.2   5.76
 51.6 
 44.5 
 Cork (CR01)  178.2   8.56
 175.7 
 191.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  257.7   43.05
 186.9 
 180 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  128.1   78.37
 162.3 
 277.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  138.1   16.29
 165 
 167.4 
 Heart embryo, roots (EHR1)  176.8   110.83
 389.3 
 228.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  271.7   145.38
 443.2 
 560.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  413.1   148
 117.8 
 247.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  279.2   200.64
 267.7 
 620.8 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  183.2   49.79
 117.9 
 215.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  354.1   359.03
 497 
 1035 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress