TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g52200
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  79.8   7.15
 88.1 
 94 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  93.7   6.45
 97 
 94.3 
 107.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  79.9   7.32
 95.6 
 93.6 
 94.1 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  86.3   5.02
 97.5 
 95.6 
 95.5 
 0.70 Seedling (SL01)  868.3   20.12
 892.6 
 908.2 
 0.70 Seedling (SL02)  604.2   85.23
 522.1 
 433.8 
 0.70 Seedling (SL10)  159.3   6.4
 154 
 166.7 
 0.70 Seedling (SL12)  881.4   53.67
 902.5 
 800.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  237.1   7.44
 222.8 
 233.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  166.3   18.31
 163.6 
 133.3 
 1.00 Seedling (SL07)  535.1   20.22
 506.5 
 1.00 Seedling (SL09)  1476.4   192.15
 1116 
 1411.6 
 1.00 Seedling (SL11)  1250.7   201.72
 1376.2 
 1712.1 
 1341.2 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  93.5   8.31
 105.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1174   254.38
 797.6 
 689.4 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1691.1   45.1
 1731.2 
 1641.2 
 1.02 Seedling (SL08)  799.4   0.16
 799.6 
 1.02 Roots (RT01)  1588.2   21.29
 1618.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  706.2   395.37
 626.7 
 1347.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1873.5   317.33
 2277.9 
 2499.3 
 1.05 Rosette (LF11)  141.4   8.97
 124.3 
 128.3 
 1.14 Rosette (LF12)  1576.1   507.78
 583.5 
 1265.9 
 1.14 Rosette (LF13)  470.3   65.69
 563.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  638.4   10.31
 618.6 
 633.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  158.1   1.2
 159.7 
 157.4 
 3.70 Adult leaf (LF02)  160.3   13.58
 140.9 
 134.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  212.9   28.4
 250.1 
 194.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  2259   1013.29
 4246 
 2907.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  500.7   756.77
 1971.3 
 1546 
 3.90 Rosette (SH01)  1029.4   42.33
 1067.6 
 983.1 
 3.90 Roots (RT04)  1564.6   517.68
 2456.5 
 2466 
 3.90 Roots (RT05)  3654.3   722.57
 2980.5 
 4424.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  106.1   9.15
 102.7 
 123 
 115 
 5.10 Flower, buds (FB01)  47.5   3.04
 51.8 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  109.5   32.41
 77 
 141.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  120.5   159.44
 78.5 
 373.2 
 5.10 Roots (RT02)  1810.8   525.71
 1067.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  124.7   24.24
 159 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  106.7   13.23
 125.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  254.1   2.06
 251.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  243.7   21.76
 274.5 
 6.00 Leaf (LF08)  1039.5   24.26
 995.8 
 999.4 
 6.00 Leaf (LF16)  4276.1   160.41
 4073.3 
 4390 
 6.00 Inflorescence (IN01)  129.5   15.29
 107.8 
 6.10 Leaf (LF10)  172.7   34.28
 111.7 
 169.4 
 6.10 Stem base (ST01)  210.6   19.3
 183.3 
 6.10 Stem top (ST02)  90.2   4.14
 96 
 6.10 Flower, open (FL01)  122.7   11.76
 106.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  66.5   11.48
 82.7 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  240   76.61
 332.6 
 180.6 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  147.4   10.75
 129.5 
 128 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1495.1   354.25
 1790.9 
 2200.5 
 Suspension cell culture (SU01)  221.1   51.9
 307.6 
 314.1 
 Suspension cell culture (SU02)  117.8   12.65
 100 
 Xylem (XL01)  113.8   14.37
 90.9 
 87.2 
 Cork (CR01)  548.8   33.57
 551.9 
 492.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  221.6   35.18
 284.3 
 280.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  245.2   73.76
 276.2 
 385.6 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  221.2   312.26
 764.3 
 225.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  224.2   44
 308.6 
 287.9 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  164.3   35.47
 171.3 
 228.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  209.4   31.67
 242.8 
 179.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  350   72.11
 230.2 
 220.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  271.6   129.31
 179.9 
 435.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  439.1   58.45
 394.1 
 323.1 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress