TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g55870
TIGR annotation:CAF1 family ribonuclease
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  298.7   24.42
 272.5 
 321.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  250.4   11.6
 257 
 237.7 
 265.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  227   10.2
 210.5 
 231.4 
 213.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  209.4   2.94
 204.3 
 208.2 
 211.3 
 0.70 Seedling (SL01)  208.7   8.48
 223.9 
 209.7 
 0.70 Seedling (SL02)  126.1   6.35
 138.8 
 133.1 
 0.70 Seedling (SL10)  168   12.03
 164 
 145.5 
 0.70 Seedling (SL12)  117.4   20.22
 90.4 
 130 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  197.8   11.88
 210.1 
 186.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  216.5   24.01
 247.5 
 200.3 
 1.00 Seedling (SL07)  153.9   17.03
 178 
 1.00 Seedling (SL09)  107.9   5.12
 118.2 
 113.1 
 1.00 Seedling (SL11)  124.5   13.28
 127.7 
 106.4 
 100.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  152.7   5.19
 160.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  135.4   15.67
 166.6 
 148.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  161.4   17.07
 162.6 
 191.5 
 1.02 Seedling (SL08)  116.6   4.08
 122.4 
 1.02 Roots (RT01)  174.3   20.67
 145.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  189.7   15.21
 203.2 
 172.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  133.2   13.07
 107.3 
 123.7 
 1.05 Rosette (LF11)  186.6   12.72
 185.4 
 164 
 1.14 Rosette (LF12)  136.2   9.3
 143 
 124.6 
 1.14 Rosette (LF13)  139.6   7.67
 128.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  164.7   3.33
 158.9 
 164.7 
 3.70 Adult leaf (LF01)  163.7   10.8
 160.5 
 180.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  168.9   4.5
 160.5 
 162 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  133.3   18.36
 146.4 
 169.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  172.1   15.16
 158.2 
 141.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  203.8   38.03
 136.9 
 139.1 
 3.90 Rosette (SH01)  136.3   11.29
 158.5 
 150.8 
 3.90 Roots (RT04)  144.2   12.13
 151 
 127.4 
 3.90 Roots (RT05)  175.8   13.15
 198.6 
 198.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  211.9   3.11
 213.2 
 206.2 
 209.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  138.3   7.39
 148.8 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  190.9   22.94
 154 
 148.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  165   21.68
 123.1 
 134.4 
 5.10 Roots (RT02)  185.5   28.05
 145.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  328.8   38.37
 383.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  280.1   28.28
 320.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  160.6   32.14
 206.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  144.5   7.66
 133.7 
 6.00 Leaf (LF08)  132.5   19.03
 160.7 
 168.7 
 6.00 Leaf (LF16)  123.9   8.36
 108.7 
 110.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  316.8   54.73
 239.4 
 6.10 Leaf (LF10)  175.9   22.33
 139.8 
 135.2 
 6.10 Stem base (ST01)  177.2   9.25
 164.2 
 6.10 Stem top (ST02)  151.2   9.08
 164 
 6.10 Flower, open (FL01)  171.2   16.97
 195.2 
 6.30 Silique, young (FS01)  135.4   42.54
 195.5 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  222.9   49.21
 140.9 
 134.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  305.5   24.67
 343.9 
 297.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  176.2   14.54
 174.2 
 150.1 
 Suspension cell culture (SU01)  264.8   43.08
 198.4 
 184 
 Suspension cell culture (SU02)  256   15.01
 234.8 
 Xylem (XL01)  210.4   3.76
 210.1 
 203.8 
 Cork (CR01)  192.5   10.97
 171.2 
 177.2 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  272.4   73.62
 192.5 
 339.6 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  213.3   47.97
 207.2 
 293.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  343.6   84.46
 175.3 
 272.1 
 Heart embryo, roots (EHR1)  245.2   39.75
 323.6 
 296.1 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  170.8   10.4
 186.9 
 167.4 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  162.3   51.26
 142.9 
 239.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  441.8   127.36
 187.5 
 301.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  201.3   35.14
 201.4 
 262.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  177.3   22.94
 220.9 
 186.7 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress