TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g56010
TIGR annotation:transcription activator NAC1 (NAC1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  119.4   8.3
 134.8 
 132.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  211.1   35.8
 286.9 
 216.3 
 219.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  222   22.03
 190.8 
 168.5 
 190.1 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  168.2   20.33
 153.2 
 131.5 
 123.7 
 0.70 Seedling (SL01)  253.9   17.4
 281.5 
 286 
 0.70 Seedling (SL02)  285.5   20.9
 289 
 251.2 
 0.70 Seedling (SL10)  161.8   23.04
 115.8 
 137.1 
 0.70 Seedling (SL12)  167.2   22.47
 126 
 162.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  344.4   27.76
 328.1 
 290.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  234.4   39.21
 279.2 
 201.1 
 1.00 Seedling (SL07)  440.1   1.32
 442 
 1.00 Seedling (SL09)  431.9   37
 478.3 
 505 
 1.00 Seedling (SL11)  298.4   60.95
 275.8 
 388.3 
 247.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  166.7   6.16
 158 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  277.9   39.41
 220.9 
 202.2 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  540.9   36.85
 545.2 
 479.4 
 1.02 Seedling (SL08)  289.8   47.8
 357.4 
 1.02 Roots (RT01)  586.7   60.13
 501.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  475.9   10.97
 472.3 
 492.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  236.1   36.9
 279.7 
 309.5 
 1.05 Rosette (LF11)  170.6   14.16
 179.9 
 152.1 
 1.14 Rosette (LF12)  430.4   32.2
 457.8 
 393.6 
 1.14 Rosette (LF13)  188   0.64
 187.1 
 3.20 Whole plant (WP05)  288.3   14.1
 260.6 
 269.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  156.6   4.84
 147 
 153 
 3.70 Adult leaf (LF02)  170.4   17.53
 137.3 
 163.8 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  670.7   180.26
 986.6 
 678.2 
 3.90 Adult leaf (LF03)  464   348.31
 1022.2 
 1104 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  229.4   154.5
 524.3 
 456.6 
 3.90 Rosette (SH01)  142.6   33.82
 207.8 
 190.9 
 3.90 Roots (RT04)  769.3   165.99
 1011.7 
 1086.9 
 3.90 Roots (RT05)  1019.2   143.32
 982.1 
 1246.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  122.9   15.64
 137.8 
 116.5 
 151.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  82.5   2.17
 79.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  189.5   32.43
 125.3 
 149.5 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  200.6   44.13
 112.4 
 159.6 
 5.10 Roots (RT02)  1196.6   81.37
 1081.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  148.4   26.6
 186.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  130.8   34.08
 179 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  287.6   15.69
 309.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  309.9   41.85
 369.1 
 6.00 Leaf (LF08)  279.7   45.11
 355.6 
 359.9 
 6.00 Leaf (LF16)  587.1   39.42
 513.3 
 574.3 
 6.00 Inflorescence (IN01)  407.3   168.47
 169 
 6.10 Leaf (LF10)  293.6   99.16
 109.1 
 138.5 
 6.10 Stem base (ST01)  329.9   35.85
 279.2 
 6.10 Stem top (ST02)  100.5   16.69
 124.1 
 6.10 Flower, open (FL01)  362.4   64.79
 270.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  99.4   8.65
 111.6 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  336.6   64.68
 450.2 
 339.9 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  131.3   11.59
 139.8 
 116.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  468.8   63.12
 595 
 534.7 
 Suspension cell culture (SU01)  297.6   35.58
 234.4 
 237.6 
 Suspension cell culture (SU02)  154.1   36.8
 206.2 
 Xylem (XL01)  223.6   11.46
 200.8 
 209.9 
 Cork (CR01)  327.6   10.68
 318.5 
 339.8 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  129.3   45.99
 155.5 
 218.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  199.1   15.07
 180.4 
 169.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  126.5   141.3
 395.4 
 185.7 
 Heart embryo, roots (EHR1)  137.9   45.56
 226.9 
 199.5 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  78.5   18.5
 75.4 
 108.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  73.9   652.63
 1210.2 
 85.7 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  233.3   53.89
 126.3 
 191.6 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  1126   514.73
 467.3 
 111.5 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  173.2   60.38
 273.7 
 281.4 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress