TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g56570
TIGR annotation:pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  128.3   8.15
 117.1 
 132.9 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  90.5   8.07
 76.4 
 95.3 
 89.5 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  94.1   3.45
 96.1 
 95.5 
 88.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  104.5   5.18
 107.9 
 111.2 
 116.7 
 0.70 Seedling (SL01)  60.3   5.8
 69.3 
 71.2 
 0.70 Seedling (SL02)  69.6   2.78
 64.4 
 65.2 
 0.70 Seedling (SL10)  88.4   9.78
 107.9 
 99.5 
 0.70 Seedling (SL12)  95.4   12.2
 110.3 
 86.1 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  83.3   1.81
 83.2 
 80.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  73.2   3.28
 67.6 
 67.5 
 1.00 Seedling (SL07)  51.9   2.67
 48.1 
 1.00 Seedling (SL09)  57.8   4.22
 62.7 
 66.2 
 1.00 Seedling (SL11)  77.4   6.56
 79.8 
 86.8 
 91.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  59.3   4.31
 65.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  61.1   18.36
 96.4 
 87.7 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  66.6   7.34
 69.9 
 55.8 
 1.02 Seedling (SL08)  64.1   1.19
 65.8 
 1.02 Roots (RT01)  64.4   6.24
 73.2 
 1.02 Lateral roots (RH01)  57.2   4.7
 52.1 
 61.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  62   5.15
 72.1 
 68.7 
 1.05 Rosette (LF11)  76.1   7.96
 60.2 
 67.6 
 1.14 Rosette (LF12)  67.7   3.42
 60.9 
 63.9 
 1.14 Rosette (LF13)  74.2   1.41
 72.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  101.8   11.43
 85 
 79.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  70.2   8.23
 86.4 
 81.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  69.6   5.5
 80.5 
 76.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  78   2.66
 80.1 
 83.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  68.4   3.35
 61.8 
 64.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  66.5   2.38
 67.2 
 71 
 3.90 Rosette (SH01)  84.9   2.85
 82.1 
 79.2 
 3.90 Roots (RT04)  62.3   2.15
 64.9 
 66.6 
 3.90 Roots (RT05)  60.7   3.14
 57.2 
 63.5 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  70.4   6.01
 77 
 83.8 
 72.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  91.4   12.42
 73.8 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  71.5   6.57
 83.1 
 71.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  60.4   9.24
 78.5 
 66.1 
 5.10 Roots (RT02)  58   0.86
 59.2 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  93.4   5.73
 85.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  94.2   2.17
 91.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  87.2   3.73
 81.9 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  108.7   8.11
 120.1 
 6.00 Leaf (LF08)  68.7   4.1
 76 
 75.7 
 6.00 Leaf (LF16)  63.5   7.26
 73.1 
 77.7 
 6.00 Inflorescence (IN01)  65.2   2.54
 68.8 
 6.10 Leaf (LF10)  78.9   3.79
 85.7 
 79.4 
 6.10 Stem base (ST01)  59.5   6.22
 68.3 
 6.10 Stem top (ST02)  71.2   0.95
 69.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  96.3   8.78
 83.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  86.7   3.38
 81.9 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  77.9   12.32
 53.9 
 61.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  103.6   12.99
 93.6 
 119.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  73.8   5.41
 66.6 
 63.2 
 Suspension cell culture (SU01)  66.1   4.83
 74.3 
 65.9 
 Suspension cell culture (SU02)  70.5   9.01
 83.2 
 Xylem (XL01)  82.1   3.11
 78.7 
 75.9 
 Cork (CR01)  78   4.26
 79.2 
 85.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  239.2   33.63
 255.2 
 303.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  272   66.14
 235.7 
 364 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  217.8   57.47
 315.9 
 215 
 Heart embryo, roots (EHR1)  195.1   48.27
 271.8 
 284.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  366   80.99
 213.8 
 241.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  224.1   49.93
 127 
 195.7 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  205.3   17.17
 179.1 
 173 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  144   91.6
 105.9 
 280.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  311   56.91
 335.2 
 226.8 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress