TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g57870
TIGR annotation:shaggy-related protein kinase kappa, putative / ASK-kappa, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  339.5   10.47
 326.4 
 347.1 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  470.9   21.34
 522.9 
 493 
 493.9 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  498.7   12.4
 514.9 
 527.7 
 521.1 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  390.6   12.59
 402.2 
 380.1 
 373.4 
 0.70 Seedling (SL01)  349.5   11.85
 361.1 
 373.2 
 0.70 Seedling (SL02)  288.1   4.45
 289.1 
 296.3 
 0.70 Seedling (SL10)  194.2   18.45
 230.2 
 219 
 0.70 Seedling (SL12)  296.6   2.01
 299.2 
 295.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  804.1   40.04
 871.9 
 801.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  691   11.52
 700.7 
 713.9 
 1.00 Seedling (SL07)  346.4   14.04
 366.2 
 1.00 Seedling (SL09)  290.6   13.09
 271 
 265.7 
 1.00 Seedling (SL11)  272.3   33.52
 299.5 
 352.5 
 300.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  602.1   11.09
 586.4 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  414.4   23.22
 368 
 390.1 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  355.8   14.6
 334.2 
 362 
 1.02 Seedling (SL08)  471.1   53.15
 395.9 
 1.02 Roots (RT01)  273.4   30.74
 316.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  419.4   25.9
 460.9 
 413.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  413.1   21.96
 449 
 409.1 
 1.05 Rosette (LF11)  386.8   21.45
 356.1 
 345.5 
 1.14 Rosette (LF12)  555.1   22.39
 595.6 
 558.8 
 1.14 Rosette (LF13)  371.6   1.43
 373.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  364.5   17.12
 385.2 
 398.5 
 3.70 Adult leaf (LF01)  355.5   15.04
 382.2 
 380.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  396.9   20.31
 369.9 
 357.1 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  508.7   60.44
 615.7 
 513.4 
 3.90 Adult leaf (LF03)  441.9   7.83
 447.1 
 457.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  401   9.67
 407.6 
 420.1 
 3.90 Rosette (SH01)  386.2   50.95
 474.6 
 474.3 
 3.90 Roots (RT04)  421.7   24.57
 380.5 
 377.9 
 3.90 Roots (RT05)  375.4   32.66
 411.8 
 440.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  284.3   19.65
 297.6 
 300.3 
 330.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  286.8   27.42
 325.6 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  408.8   16.17
 376.8 
 396.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  469   52.89
 414.9 
 363.2 
 5.10 Roots (RT02)  443.5   9.19
 430.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  327.7   32.86
 374.2 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  320.1   46.72
 386.2 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  304.3   4.81
 311.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  307.5   3.4
 312.3 
 6.00 Leaf (LF08)  444.7   8.75
 455.8 
 438.6 
 6.00 Leaf (LF16)  340.2   4.59
 337.3 
 331.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  456.7   9.14
 443.8 
 6.10 Leaf (LF10)  557   45.76
 481.1 
 474.7 
 6.10 Stem base (ST01)  1114.2   23.04
 1081.6 
 6.10 Stem top (ST02)  477.1   23.94
 511 
 6.10 Flower, open (FL01)  388.5   8.9
 375.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  288.7   9.83
 302.6 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  768.9   97.5
 591.8 
 609.5 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  471.4   48.24
 415.5 
 375.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  699.5   49.85
 608.3 
 619 
 Suspension cell culture (SU01)  304.4   20.15
 268.5 
 270.7 
 Suspension cell culture (SU02)  318.5   5.11
 325.7 
 Xylem (XL01)  834.6   53.85
 854.7 
 936.3 
 Cork (CR01)  565.1   39.84
 626.8 
 639.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  408.1   234.78
 267 
 725.4 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  561.9   213.77
 272.6 
 689.9 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  353.3   2282.67
 587.9 
 4419 
 Heart embryo, roots (EHR1)  583.7   547.84
 707.4 
 1588.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  237.5   82.9
 382.7 
 240.9 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  326.4   220.89
 765.6 
 587.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  715.5   97.48
 523 
 646.1 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  746.2   188.5
 742.5 
 1070.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  697.3   166.12
 948 
 633.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress