TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g64190
TIGR annotation:6-phosphogluconate dehydrogenase family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  532.5   105.15
 742.1 
 651.8 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  333.9   36.26
 265.7 
 345.6 
 332.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  316.3   19.93
 337.6 
 331.5 
 292.9 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  633.5   30.25
 650.7 
 639.1 
 582.3 
 0.70 Seedling (SL01)  1280.3   11.89
 1301.2 
 1300.6 
 0.70 Seedling (SL02)  1520.9   12.46
 1543.8 
 1523.7 
 0.70 Seedling (SL10)  2302.7   171.03
 2592.2 
 2605.2 
 0.70 Seedling (SL12)  1661.9   53.28
 1618.5 
 1724.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  647.4   64.81
 556.7 
 682.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  2090.2   33.81
 2087.6 
 2030.4 
 1.00 Seedling (SL07)  1433.3   38.11
 1379.4 
 1.00 Seedling (SL09)  1428.3   68.57
 1291.4 
 1366.7 
 1.00 Seedling (SL11)  1317.3   234.91
 1513.2 
 1853.3 
 1718.2 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1728.3   4.55
 1721.9 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1707.9   158.33
 1542.3 
 1858.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  715.8   66.41
 586.7 
 624.4 
 1.02 Seedling (SL08)  1682.2   81.66
 1566.7 
 1.02 Roots (RT01)  3583.8   318.74
 3133 
 1.02 Lateral roots (RH01)  4689.2   283.88
 4151.9 
 4579.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  2482.6   109.94
 2391.5 
 2263.7 
 1.05 Rosette (LF11)  1407.4   44.14
 1320.2 
 1352.2 
 1.14 Rosette (LF12)  1490.2   113.85
 1280.5 
 1462.1 
 1.14 Rosette (LF13)  1312.3   121.66
 1484.3 
 3.20 Whole plant (WP05)  1265.9   29.7
 1268.6 
 1215.9 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1388   50.84
 1306.8 
 1294.5 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1265.1   16.61
 1287.5 
 1297.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1622.9   140.75
 1354.4 
 1415.4 
 3.90 Adult leaf (LF03)  980   56.17
 1087.3 
 1004.8 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1106.6   118.24
 1331 
 1283.3 
 3.90 Rosette (SH01)  1548.6   34.76
 1497.1 
 1563.3 
 3.90 Roots (RT04)  3695.8   121.43
 3526.1 
 3460.4 
 3.90 Roots (RT05)  3763.3   164.63
 3521.7 
 3836.2 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1371.6   142.46
 1688.7 
 1646.8 
 1614.3 
 5.10 Flower, buds (FB01)  301.5   82.29
 417.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  421.4   138.01
 689.7 
 611.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  528.2   116.6
 758.9 
 613.6 
 5.10 Roots (RT02)  4069.9   483.97
 3385.5 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  813.2   11
 797.7 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  751.6   14.01
 731.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  319.9   17.59
 295 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  290.4   17.67
 265.4 
 6.00 Leaf (LF08)  1731.7   205.72
 1491.3 
 1322.4 
 6.00 Leaf (LF16)  985.6   84.66
 1111.6 
 1146.6 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1300.7   211.51
 1599.8 
 6.10 Leaf (LF10)  1090.4   111.51
 1188.6 
 1312.9 
 6.10 Stem base (ST01)  484.7   34.93
 435.3 
 6.10 Stem top (ST02)  521.4   34.63
 472.4 
 6.10 Flower, open (FL01)  346.4   20.66
 375.7 
 6.30 Silique, young (FS01)  389.8   48.33
 458.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1374.4   20.38
 1357.1 
 1333.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  306.2   183.72
 386.4 
 656.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1197.1   87
 1259.1 
 1368.9 
 Suspension cell culture (SU01)  470.5   44.36
 529.1 
 557.5 
 Suspension cell culture (SU02)  501.6   21.2
 531.6 
 Xylem (XL01)  2254.1   95.87
 2139.8 
 2330.3 
 Cork (CR01)  1950.4   100.7
 1874.5 
 1750.9 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  847.4   1057.48
 2850.9 
 2435.8 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  808.1   59.19
 872.2 
 926.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  3832.6   1887.14
 448.2 
 693.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  6438.6   3732.23
 7492.9 
 566.1 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  4512.4   500.37
 4648.5 
 5439 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  5767.5   1271.42
 3325.5 
 5160.5 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  375.7   1564.43
 3428.8 
 1309.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  1171.6   2460
 5565.4 
 5285.8 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  1588.9   1241.78
 1973.2 
 3906 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress