TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g68300
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  140.7   38.49
 213.8 
 156.2 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  442.8   56.47
 524.4 
 501.7 
 400.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  365.7   19.02
 323 
 333.9 
 329.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  299.7   29.92
 263.6 
 240.2 
 233.4 
 0.70 Seedling (SL01)  1210.5   95.46
 1116.4 
 1019.5 
 0.70 Seedling (SL02)  1061.4   48.8
 1021.8 
 964.4 
 0.70 Seedling (SL10)  927.4   97.87
 739.3 
 880.2 
 0.70 Seedling (SL12)  805.9   94.54
 939.9 
 757.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1982.6   40.91
 1924.8 
 1903.6 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1055.2   68.01
 1187.4 
 1093.7 
 1.00 Seedling (SL07)  1006   80.8
 891.8 
 1.00 Seedling (SL09)  1349.2   120.72
 1439.9 
 1588.3 
 1.00 Seedling (SL11)  939.2   121.17
 898.6 
 1041.8 
 1170.1 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1340.5   65.36
 1248.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1002.3   153.83
 718.3 
 757.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  2181.3   20.83
 2202.1 
 2160.4 
 1.02 Seedling (SL08)  1727.7   244.52
 2073.5 
 1.02 Roots (RT01)  1624.9   181.29
 1881.3 
 1.02 Lateral roots (RH01)  1958   173.66
 1897.6 
 2224 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1046.9   163.06
 1359.2 
 1284.6 
 1.05 Rosette (LF11)  701.5   41.97
 621.9 
 684.6 
 1.14 Rosette (LF12)  1083.5   39.7
 1033.8 
 1005 
 1.14 Rosette (LF13)  963.2   35.22
 1013 
 3.20 Whole plant (WP05)  761.5   33.58
 772.3 
 824.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  761.9   12.66
 742.8 
 738 
 3.70 Adult leaf (LF02)  786.5   29.08
 729.6 
 747.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  917.1   119.55
 1138.5 
 949.5 
 3.90 Adult leaf (LF03)  880.8   170.43
 1150.3 
 1196.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  720.3   155.41
 1026.3 
 920.6 
 3.90 Rosette (SH01)  1165   79.85
 1261.5 
 1323.5 
 3.90 Roots (RT04)  1528.1   76.93
 1673.6 
 1644.2 
 3.90 Roots (RT05)  1650.2   360.8
 1563.2 
 2227.1 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  533   30.33
 598.7 
 592.9 
 562.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  898.3   24.85
 933.4 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1124   235.64
 1594.2 
 1330.6 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1245.6   180.79
 1331.8 
 1592.8 
 5.10 Roots (RT02)  1408.3   285.2
 1811.6 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  577.9   49.34
 508.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  627.9   12.45
 610.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  613.3   5.49
 621.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  380.6   40.56
 323.2 
 6.00 Leaf (LF08)  1593.1   312.73
 1098.8 
 1014.1 
 6.00 Leaf (LF16)  1145.9   44.68
 1206.7 
 1119.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  781.3   61.86
 868.8 
 6.10 Leaf (LF10)  1014.3   31.21
 1069.4 
 1016.5 
 6.10 Stem base (ST01)  2437.1   68.31
 2340.6 
 6.10 Stem top (ST02)  1018.1   22.31
 1049.7 
 6.10 Flower, open (FL01)  1171.4   108.77
 1017.6 
 6.30 Silique, young (FS01)  979.9   19.55
 952.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1550.8   94.64
 1659.4 
 1739.3 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  319.9   102.41
 363.4 
 168.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1563.1   80.6
 1711.4 
 1691.9 
 Suspension cell culture (SU01)  3171.2   543.62
 4256.7 
 3766.4 
 Suspension cell culture (SU02)  2164.9   355.99
 1661.5 
 Xylem (XL01)  1711.9   127.43
 1582.1 
 1836.9 
 Cork (CR01)  1593.4   88.38
 1720.6 
 1763.3 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  268.5   41.1
 279.9 
 344.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  275.7   400.37
 1028.7 
 416.4 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  364   8
 349.8 
 350.5 
 Heart embryo, roots (EHR1)  740.4   396.51
 364.7 
 1157.4 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  483.9   83.51
 357.6 
 326 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  588.2   218.81
 176.3 
 510.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  972.8   388.52
 253.5 
 867.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  478.1   136.62
 442.9 
 695.2 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  461.8   176.27
 203.2 
 125 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress