TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g69080
TIGR annotation:universal stress protein (USP) family protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  290.6   19.43
 257.1 
 256.9 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  514.7   81.16
 711.4 
 588 
 602.7 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  545.3   50.6
 568.1 
 496.5 
 618.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  277.7   23.07
 324.8 
 310.1 
 328.4 
 0.70 Seedling (SL01)  1044.5   15.66
 1036.1 
 1066.4 
 0.70 Seedling (SL02)  572.4   93.98
 674.2 
 486.5 
 0.70 Seedling (SL10)  173.5   13.77
 191 
 200.7 
 0.70 Seedling (SL12)  277.9   18.65
 308.1 
 274.1 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  189.8   15.54
 161 
 165.2 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  248   7.77
 245.2 
 259.9 
 1.00 Seedling (SL07)  681   55.42
 602.6 
 1.00 Seedling (SL09)  185.3   3.86
 191.3 
 184 
 1.00 Seedling (SL11)  184.3   17.39
 194.7 
 158.4 
 195.9 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  498.8   5.52
 491 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  567.7   81.99
 436.9 
 416.6 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  348.7   103.36
 460.6 
 555.2 
 1.02 Seedling (SL08)  376.2   29.15
 417.4 
 1.02 Roots (RT01)  417.7   40.23
 474.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  770.8   125.91
 736.2 
 537.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  555.4   72.5
 419.6 
 443.4 
 1.05 Rosette (LF11)  540.5   73.77
 425.7 
 402.8 
 1.14 Rosette (LF12)  559.7   52.28
 467.9 
 557.2 
 1.14 Rosette (LF13)  433.1   22.22
 401.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  219.1   7.23
 229.5 
 215.5 
 3.70 Adult leaf (LF01)  432.5   14.28
 408.8 
 406.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  414.3   19.71
 375 
 397.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  614.5   156.39
 793.7 
 926.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1140.7   386.18
 449 
 497.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1059.8   337.78
 439.7 
 517.7 
 3.90 Rosette (SH01)  386.2   43.18
 424 
 472.3 
 3.90 Roots (RT04)  298.5   37.63
 349.9 
 371.8 
 3.90 Roots (RT05)  446.5   85.5
 557.2 
 614.7 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  449.9   48.52
 340.2 
 424.3 
 379.6 
 5.10 Flower, buds (FB01)  156   6.53
 146.8 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  635.6   237.67
 208.4 
 241.6 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  455.6   126.02
 224.7 
 252.5 
 5.10 Roots (RT02)  661.1   218.28
 352.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  572.9   166.85
 808.8 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  560.6   226.71
 881.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  613.1   144.5
 817.5 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  637   135.65
 828.8 
 6.00 Leaf (LF08)  565.7   51.04
 559.5 
 650.8 
 6.00 Leaf (LF16)  179.2   5.08
 171.1 
 169.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  563.3   142.64
 361.6 
 6.10 Leaf (LF10)  882.6   295.45
 393.5 
 350.9 
 6.10 Stem base (ST01)  808.6   125.13
 985.5 
 6.10 Stem top (ST02)  458.8   260.78
 827.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  189.8   28.28
 149.8 
 6.30 Silique, young (FS01)  304   70.55
 204.2 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  892.3   283.37
 399.8 
 403.3 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  680.5   82.95
 646.5 
 522.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  913.6   334.56
 321.5 
 347.8 
 Suspension cell culture (SU01)  1143.6   327.54
 572.2 
 580.5 
 Suspension cell culture (SU02)  1082.1   6.41
 1091.2 
 Xylem (XL01)  235   19.16
 218.8 
 257 
 Cork (CR01)  203.9   21.01
 179.4 
 162.1 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  385.7   210.53
 287.4 
 691.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  479.3   75.26
 386.5 
 330.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  184.2   369.56
 900.3 
 383.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  294.1   25.95
 343.1 
 303.8 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  215.9   27.63
 255.5 
 269 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  234.7   33.34
 175.4 
 231.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  497.6   93.08
 317.5 
 448.5 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  326.8   125.1
 177.4 
 425.9 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  366.9   38.44
 389.8 
 441.9 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress