TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g75040
TIGR annotation:pathogenesis-related protein 5 (PR-5)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  91.3   8.86
 109 
 99.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  133.9   45.25
 223.6 
 135.4 
 130.4 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  128   15.13
 103.5 
 91.7 
 108.7 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  109.7   8.55
 107.7 
 100.5 
 90.8 
 0.70 Seedling (SL01)  100.5   4.4
 93.7 
 101.9 
 0.70 Seedling (SL02)  118.4   9.53
 110.7 
 99.5 
 0.70 Seedling (SL10)  87.3   5.39
 77.9 
 87.2 
 0.70 Seedling (SL12)  78.6   19.93
 113.7 
 79.9 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  102.1   12
 125.5 
 118.6 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  401.1   39.5
 410.2 
 337.7 
 1.00 Seedling (SL07)  100.7   4.4
 106.9 
 1.00 Seedling (SL09)  153.2   19.75
 122.9 
 116.2 
 1.00 Seedling (SL11)  82.2   17.16
 82.3 
 105.9 
 116.3 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  141.4   9.96
 155.5 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  164.3   15.78
 149.8 
 132.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  416.1   31.42
 451.8 
 389.1 
 1.02 Seedling (SL08)  250.7   2.24
 247.5 
 1.02 Roots (RT01)  77.8   9.79
 91.6 
 1.02 Lateral roots (RH01)  124.4   12.57
 119.2 
 100.5 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  274.4   64.2
 298.4 
 177.2 
 1.05 Rosette (LF11)  734.6   96.12
 543.4 
 621.7 
 1.14 Rosette (LF12)  4876.3   1673.64
 8223.5 
 6565.9 
 1.14 Rosette (LF13)  196.3   3.81
 201.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  1729.8   37.65
 1679.7 
 1753.3 
 3.70 Adult leaf (LF01)  2172   350.34
 1532.6 
 1604.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  2282.1   907.35
 468.4 
 1427.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  2731.7   1384.35
 4242.8 
 1478.1 
 3.90 Adult leaf (LF03)  3606.2   735.69
 3933.8 
 5012.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  922.7   318.75
 1417.6 
 1518.1 
 3.90 Rosette (SH01)  2863.9   572.69
 2171.5 
 3307.9 
 3.90 Roots (RT04)  104.3   7.5
 98.6 
 89.5 
 3.90 Roots (RT05)  113.4   33.81
 156.3 
 180.1 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  401.8   119.67
 688.7 
 582.6 
 523.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  152.3   29.43
 110.7 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  124   428.49
 161.4 
 884.2 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  393.9   1364.02
 280.4 
 2697.6 
 5.10 Roots (RT02)  73.3   6.05
 81.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  147.4   0.04
 147.3 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  150.5   4.43
 156.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  264.2   16.65
 287.8 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  260.2   7.63
 271 
 6.00 Leaf (LF08)  3817.9   2050.75
 397.2 
 147.7 
 6.00 Leaf (LF16)  213.6   22.39
 202.8 
 245.8 
 6.00 Inflorescence (IN01)  239.1   25.55
 203 
 6.10 Leaf (LF10)  165.3   198.35
 117.1 
 482.2 
 6.10 Stem base (ST01)  2348.2   340.88
 2830.3 
 6.10 Stem top (ST02)  167.6   17.67
 142.6 
 6.10 Flower, open (FL01)  446.2   46.21
 380.9 
 6.30 Silique, young (FS01)  147.9   14.21
 168 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  398.3   1078.47
 627 
 2370.1 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  89.9   1.8
 86.6 
 86.9 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  10579.9   843.95
 12091.6 
 10685.5 
 Suspension cell culture (SU01)  193.3   65.44
 77.1 
 83 
 Suspension cell culture (SU02)  95.9   35.26
 145.8 
 Xylem (XL01)  111.4   13.51
 129.8 
 103.5 
 Cork (CR01)  1004.9   39.52
 984.2 
 1060.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  236.2   14.83
 206.8 
 224.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  270   32.06
 218.6 
 277.5 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  181.4   9.68
 200.5 
 188 
 Heart embryo, roots (EHR1)  179.4   41.84
 259 
 196.6 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  109.3   16.95
 135.4 
 141.1 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  134.7   245.67
 557.3 
 129 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  227.8   33.48
 168.8 
 225.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  562.6   173.84
 278.3 
 247.1 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  267.9   61.42
 176.4 
 151.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress