TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At1g80830
TIGR annotation:NRAMP metal ion transporter 1 (NRAMP1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1373   152.14
 1410.3 
 1130.1 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  494.7   30.83
 536.7 
 463.3 
 512 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  467.3   17.75
 471.9 
 439 
 439 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  892.7   20.96
 869.7 
 918.5 
 906.7 
 0.70 Seedling (SL01)  685.2   19.81
 694.1 
 723.1 
 0.70 Seedling (SL02)  904.4   61.57
 852 
 781.7 
 0.70 Seedling (SL10)  938.8   11.42
 943.6 
 960.6 
 0.70 Seedling (SL12)  893.1   41.97
 811.2 
 836.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  748.8   44.92
 838.5 
 789.7 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1340.4   58.3
 1407 
 1290.8 
 1.00 Seedling (SL07)  1144   9.2
 1157 
 1.00 Seedling (SL09)  1257.4   55.93
 1262.1 
 1356.5 
 1.00 Seedling (SL11)  686.7   336.4
 722.8 
 1397.7 
 1093.5 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  491.5   15.52
 513.5 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1148.2   61.68
 1028.7 
 1115 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  761.9   70.2
 751.1 
 635.3 
 1.02 Seedling (SL08)  1371.1   180.83
 1115.4 
 1.02 Roots (RT01)  2616.8   529.94
 1867.4 
 1.02 Lateral roots (RH01)  931.7   88.1
 903 
 1067.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  981.9   141.26
 971.4 
 1221.2 
 1.05 Rosette (LF11)  766.2   53.93
 721.4 
 828.8 
 1.14 Rosette (LF12)  696.3   46.92
 788.1 
 759 
 1.14 Rosette (LF13)  758.3   119.41
 927.2 
 3.20 Whole plant (WP05)  413.1   35.19
 451.4 
 483.4 
 3.70 Adult leaf (LF01)  435.9   1.84
 436 
 432.8 
 3.70 Adult leaf (LF02)  505.4   22.45
 462 
 473.6 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  560.6   58.76
 588.5 
 475.7 
 3.90 Adult leaf (LF03)  649.9   104.94
 454.8 
 485.3 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1257   75.49
 1308.3 
 1159.7 
 3.90 Rosette (SH01)  708.1   24.7
 756.7 
 740.3 
 3.90 Roots (RT04)  2018.8   498.11
 2998.8 
 2663.6 
 3.90 Roots (RT05)  2431.1   236.95
 2244 
 2714.6 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  402.2   20.31
 436.4 
 394.1 
 393.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  531.9   132.39
 719.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  693.8   62.19
 815.8 
 775.8 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1174.9   212.05
 800.7 
 815 
 5.10 Roots (RT02)  1352.2   29.75
 1310.1 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  1473.3   28.84
 1432.5 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  1369   19.59
 1341.3 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  380.9   16.77
 357.2 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  458   47.29
 391.1 
 6.00 Leaf (LF08)  736.2   194.04
 1119.2 
 981.5 
 6.00 Leaf (LF16)  777.7   23.36
 785.9 
 821.7 
 6.00 Inflorescence (IN01)  523.1   3.01
 518.8 
 6.10 Leaf (LF10)  408.2   52.43
 414.3 
 501.9 
 6.10 Stem base (ST01)  2123.3   11.04
 2138.9 
 6.10 Stem top (ST02)  647.6   0.08
 647.5 
 6.10 Flower, open (FL01)  631.7   159.64
 857.5 
 6.30 Silique, young (FS01)  649.5   47.06
 716.1 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1524.4   205.96
 1936.3 
 1734.3 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  485.4   133.04
 480.4 
 713.3 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1703.3   222.54
 2071.1 
 2104.3 
 Suspension cell culture (SU01)  1325.7   161.79
 1586 
 1622.3 
 Suspension cell culture (SU02)  604.8   82.33
 488.4 
 Xylem (XL01)  460.8   105.13
 669.8 
 545.6 
 Cork (CR01)  1177.8   34.49
 1109.8 
 1153.7 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  948.4   384.67
 1063.1 
 346.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  321.1   433.48
 1129 
 452.8 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  892.3   318.13
 285.6 
 422.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1321.4   505.59
 499.7 
 400.1 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  2337.6   441.73
 1933.8 
 1455.2 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1089.7   1407.26
 388.6 
 3099.8 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  363.5   498.23
 1203.6 
 319.4 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  661.7   52.51
 730.7 
 627.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  478.5   58.28
 574.8 
 469.7 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress