TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g05710
TIGR annotation:aconitate hydratase, cytoplasmic, putative / citrate hydro-lyase/aconitase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  8345.5   1579.82
 5780.5 
 5465.1 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  2374.9   130.69
 2275 
 2558.2 
 2287.3 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  2907.4   125.96
 3076.4 
 3213.1 
 3096.5 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  5455.9   183.78
 5220.5 
 5642 
 5312.4 
 0.70 Seedling (SL01)  3608.6   87.74
 3781.8 
 3720 
 0.70 Seedling (SL02)  1909.7   264.19
 2001.2 
 2406.1 
 0.70 Seedling (SL10)  5562.5   440.46
 6442.7 
 6032.9 
 0.70 Seedling (SL12)  3147.4   632.85
 2030.2 
 3104 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  2851.1   231.18
 3295.4 
 3184.1 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  2786.2   120.9
 3021.4 
 2952.3 
 1.00 Seedling (SL07)  1748.7   89.28
 1874.9 
 1.00 Seedling (SL09)  1805.4   149.7
 2103.5 
 1930 
 1.00 Seedling (SL11)  1732.4   359.42
 1886.8 
 2539.3 
 1887 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  2072.8   28.33
 2032.7 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1245.4   254.02
 1645.5 
 1716.5 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1373.4   75.67
 1489.3 
 1347 
 1.02 Seedling (SL08)  3983.4   362.87
 3470.3 
 1.02 Roots (RT01)  2554.9   195.83
 2831.8 
 1.02 Lateral roots (RH01)  3863.6   114.58
 3787 
 3638.3 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  2113.6   206.66
 1709.2 
 1837.4 
 1.05 Rosette (LF11)  2028.6   178.17
 1693.8 
 1755.5 
 1.14 Rosette (LF12)  2350.4   533.85
 3407.4 
 2748.6 
 1.14 Rosette (LF13)  1687.8   86.86
 1810.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  894   20.66
 863.7 
 903.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1535.2   88.42
 1414.6 
 1363 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1653.6   76.83
 1538.8 
 1507.7 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  2381   160.14
 2352.2 
 2090.4 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1736.8   443.25
 2296.6 
 2612 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1865.2   135.14
 2126.1 
 2057 
 3.90 Rosette (SH01)  1877.7   538.85
 2926.7 
 2188.2 
 3.90 Roots (RT04)  2149.4   133.38
 2286.7 
 2020 
 3.90 Roots (RT05)  1543.7   41.6
 1483.8 
 1463.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1372.3   95.05
 1565.3 
 1486.9 
 1369.9 
 5.10 Flower, buds (FB01)  2783.8   248.33
 3134.9 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1891.7   224.94
 2232.5 
 2316.4 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  1930.4   369.78
 2663.9 
 2379.6 
 5.10 Roots (RT02)  2803.5   204.92
 2513.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  2594.3   144.85
 2389.4 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  2779.8   250.83
 2425 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  2556   201.49
 2271 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  1010.6   427.97
 405.3 
 6.00 Leaf (LF08)  2663.6   457.09
 1962.4 
 1804.9 
 6.00 Leaf (LF16)  2073.4   84.43
 1920.8 
 2059.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1575.7   103.84
 1722.6 
 6.10 Leaf (LF10)  1427.1   199.55
 1750.8 
 1791.1 
 6.10 Stem base (ST01)  2318.9   179.54
 2065 
 6.10 Stem top (ST02)  2211.3   232.19
 1883 
 6.10 Flower, open (FL01)  2937.3   187.14
 3202 
 6.30 Silique, young (FS01)  2331.2   94.55
 2465 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  2868.5   674.35
 1567.7 
 1909.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  4833.4   352.36
 4209.7 
 4237.5 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  2787.2   251.77
 2285.1 
 2502.6 
 Suspension cell culture (SU01)  3639.1   544.9
 4685.8 
 4425.3 
 Suspension cell culture (SU02)  3104.4   53.49
 3028.7 
 Xylem (XL01)  2530.4   168.17
 2772.1 
 2853.8 
 Cork (CR01)  3461.3   207.87
 3100.9 
 3101.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  178.5   34.37
 111.7 
 131.1 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  119.8   74.03
 249.9 
 123.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  353.8   126.87
 176.8 
 107.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  477.5   221.09
 105.7 
 84.2 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  692.2   115.05
 484.4 
 673.8 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  788.6   284.73
 313.5 
 822.9 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  1921.3   825.08
 274.1 
 1012 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  206.6   307.83
 663.7 
 78 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  253.2   78.18
 148.4 
 301.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress