TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g18950
TIGR annotation:homogentisate phytylprenyltransferase family protein (HPT1) / tocopherol phytyltransferase family protein (TPT1)
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  166.3   33.07
 196.2 
 232.3 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  131.1   10.64
 118.9 
 141.4 
 141.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  116.5   6
 127.1 
 130.3 
 122.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  160.3   4.61
 166.3 
 171.4 
 164.3 
 0.70 Seedling (SL01)  126.4   10.65
 138.5 
 117.3 
 0.70 Seedling (SL02)  145   4.94
 135.6 
 137.8 
 0.70 Seedling (SL10)  203.3   16.33
 227.8 
 234.2 
 0.70 Seedling (SL12)  120.5   6.6
 113 
 107.4 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  607   32.72
 571.9 
 541.6 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  309.5   4.23
 304.9 
 301.1 
 1.00 Seedling (SL07)  283.5   65.5
 376.1 
 1.00 Seedling (SL09)  168.9   7.16
 180.8 
 181.7 
 1.00 Seedling (SL11)  273.2   48.91
 265.1 
 263 
 364.5 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  302.2   1.6
 300 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  442.3   122.07
 651.5 
 655.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  350.4   14.64
 324.2 
 325.9 
 1.02 Seedling (SL08)  532.3   72.95
 429.1 
 1.02 Roots (RT01)  150.4   49.15
 219.9 
 1.02 Lateral roots (RH01)  99.7   3.88
 92 
 96.8 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  352.8   42.4
 436.6 
 405.6 
 1.05 Rosette (LF11)  417   17.48
 418.9 
 448.2 
 1.14 Rosette (LF12)  584.8   77.41
 719.2 
 585.5 
 1.14 Rosette (LF13)  525.5   0.36
 525 
 3.20 Whole plant (WP05)  578.3   9.49
 561.8 
 578.1 
 3.70 Adult leaf (LF01)  283.2   24.2
 248.9 
 236.4 
 3.70 Adult leaf (LF02)  278.2   22.93
 323.6 
 295.5 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  539.3   98.71
 391.6 
 352 
 3.90 Adult leaf (LF03)  475   67.17
 573.6 
 603.4 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  382.4   54.92
 306.5 
 275.7 
 3.90 Rosette (SH01)  579.1   78.25
 664 
 735.5 
 3.90 Roots (RT04)  125.8   40.78
 206.8 
 174.6 
 3.90 Roots (RT05)  136.2   9.6
 134.3 
 118.7 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  540.2   14.97
 523.8 
 558.2 
 530.4 
 5.10 Flower, buds (FB01)  575.2   17.87
 600.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  451.5   106.98
 366.4 
 579 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  491.1   111.58
 711.3 
 569.8 
 5.10 Roots (RT02)  135.5   12.06
 118.4 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  151.5   1.52
 153.6 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  153.5   14.67
 132.7 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  123.7   8.55
 111.6 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  116.7   10.05
 102.5 
 6.00 Leaf (LF08)  851.1   248.18
 375.5 
 490.4 
 6.00 Leaf (LF16)  583.7   11.48
 602.7 
 604.4 
 6.00 Inflorescence (IN01)  434.8   12.48
 452.5 
 6.10 Leaf (LF10)  343.6   166.79
 599.2 
 657 
 6.10 Stem base (ST01)  406.1   21.53
 375.7 
 6.10 Stem top (ST02)  592.9   27.25
 554.4 
 6.10 Flower, open (FL01)  792.8   115.73
 629.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  575.5   5.81
 567.3 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  332.1   41.63
 376.8 
 415.3 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  183.1   21.34
 149.9 
 143.2 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  514.6   179.37
 717.1 
 872.3 
 Suspension cell culture (SU01)  701.5   303.02
 1155.3 
 1276.3 
 Suspension cell culture (SU02)  917.6   212.89
 616.5 
 Xylem (XL01)  419.9   45.32
 347 
 336.8 
 Cork (CR01)  483.5   32.18
 443 
 506.6 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  400.4   207.96
 779.1 
 440.9 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  341.2   51.78
 242.9 
 263.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1025   418.01
 392.8 
 235.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  316   832.06
 267.6 
 1732.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  903.1   288.58
 754.1 
 1311.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1180.2   525.67
 180.9 
 963.4 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  293.5   477.45
 1134.2 
 321.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  224.4   547.21
 552.3 
 1292.6 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  346   130.16
 104.5 
 141 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress