TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g20360
TIGR annotation:expressed protein
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  1936.5   198.95
 1681.5 
 2073.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  824   48.95
 818.1 
 855.1 
 740.1 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  1027.4   33.96
 1002.6 
 1031 
 957.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  1954.8   104.88
 2037.4 
 2136.7 
 1895.1 
 0.70 Seedling (SL01)  1724   43.02
 1717.6 
 1795.2 
 0.70 Seedling (SL02)  1526.1   63.6
 1485.9 
 1610.5 
 0.70 Seedling (SL10)  2133   275.75
 2572 
 2641.6 
 0.70 Seedling (SL12)  1750.3   162.48
 1545.8 
 1866.8 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  1039.3   52.82
 1135.4 
 1049.3 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  1530.5   88.91
 1478.3 
 1651.6 
 1.00 Seedling (SL07)  1675.8   15.75
 1698.1 
 1.00 Seedling (SL09)  1333.7   45.08
 1348.6 
 1418.2 
 1.00 Seedling (SL11)  1758.1   135.82
 1725.2 
 2009.9 
 1926.4 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  1611.3   55.7
 1690.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  1734.8   87.13
 1814.7 
 1908.8 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  1185.8   36.97
 1259.1 
 1230.8 
 1.02 Seedling (SL08)  1668.2   164.24
 1435.9 
 1.02 Roots (RT01)  1898.9   179.94
 2153.4 
 1.02 Lateral roots (RH01)  2586.6   69.63
 2499.3 
 2636.9 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  1738   87.03
 1644.9 
 1818.8 
 1.05 Rosette (LF11)  1501.3   81.59
 1338.8 
 1433.3 
 1.14 Rosette (LF12)  1493.5   46.47
 1407 
 1479.6 
 1.14 Rosette (LF13)  1571.9   23.49
 1538.7 
 3.20 Whole plant (WP05)  1207.4   30.26
 1172.3 
 1232.6 
 3.70 Adult leaf (LF01)  1509.9   26.21
 1458.1 
 1490.9 
 3.70 Adult leaf (LF02)  1538.4   13.61
 1511.2 
 1524.9 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  1751.7   94.3
 1645.2 
 1563.6 
 3.90 Adult leaf (LF03)  1582.3   336.14
 1068.1 
 950.1 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  1690   226.71
 1270.9 
 1330.6 
 3.90 Rosette (SH01)  1698.4   72.78
 1753.1 
 1609 
 3.90 Roots (RT04)  1618.3   136.67
 1731.1 
 1459 
 3.90 Roots (RT05)  1467.7   93.73
 1655.1 
 1563.4 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  1653.6   34.21
 1718.1 
 1659 
 1712.5 
 5.10 Flower, buds (FB01)  2075.6   344.83
 2563.3 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  1972.9   77.22
 1832.3 
 1957.9 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  2130.9   143.71
 2124.4 
 1878.8 
 5.10 Roots (RT02)  1993.9   187.55
 1728.7 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  2096.4   158.63
 1872.1 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  2357.6   33.11
 2310.8 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  2761.1   33.94
 2809.1 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  1308.2   472.28
 640.3 
 6.00 Leaf (LF08)  1645.7   135.21
 1507.3 
 1375.3 
 6.00 Leaf (LF16)  1261.2   27.62
 1315.9 
 1295.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  1118.7   339.17
 1598.4 
 6.10 Leaf (LF10)  1376.6   142.58
 1642.4 
 1598.9 
 6.10 Stem base (ST01)  1649.8   78.11
 1539.3 
 6.10 Stem top (ST02)  2038.2   199.17
 2319.9 
 6.10 Flower, open (FL01)  1868.4   240.95
 2209.1 
 6.30 Silique, young (FS01)  2061.3   14.65
 2082 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  1249.2   138.26
 1433.7 
 1519.8 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  1006.1   145.39
 1090.9 
 1289.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  1060.6   258.33
 1528.4 
 1484.5 
 Suspension cell culture (SU01)  1291.7   143.53
 1495 
 1568.9 
 Suspension cell culture (SU02)  1298.8   199.09
 1017.3 
 Xylem (XL01)  1012.3   40.14
 1089.7 
 1069.5 
 Cork (CR01)  1266.4   65.54
 1327.7 
 1397.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  1956.5   598.26
 775.1 
 1530.2 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  1341.9   617.06
 1481.3 
 349.7 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  1483.2   723.5
 140.4 
 344.8 
 Heart embryo, roots (EHR1)  1257.3   1178.87
 3383.1 
 3203.3 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  2058.4   216.81
 1643.2 
 1742.5 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  1820.7   943.74
 439.1 
 2243.6 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  460.1   634.46
 1727 
 1031.7 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  188   270.77
 708 
 317 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  240.7   75.84
 263.6 
 382 
Normalisation: MAS4
change to: MAS5
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress