TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g21940
TIGR annotation:shikimate kinase, putative
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  229.3   25.01
 180.5 
 195.5 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  627.2   20.05
 596.1 
 629.6 
 591.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  495.8   22.85
 513.2 
 505.1 
 461.3 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  227   23.36
 193.5 
 194.9 
 240.2 
 0.70 Seedling (SL01)  176.1   7.3
 161.9 
 165.9 
 0.70 Seedling (SL02)  146   1.41
 148.8 
 147.7 
 0.70 Seedling (SL10)  144.4   6.61
 143.5 
 155.4 
 0.70 Seedling (SL12)  125.9   8.21
 141.5 
 129.3 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  481.3   10.66
 485.7 
 465.4 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  314.3   12.76
 327.7 
 302.2 
 1.00 Seedling (SL07)  214.3   17.56
 189.5 
 1.00 Seedling (SL09)  180.8   13.05
 175.7 
 200.4 
 1.00 Seedling (SL11)  181   18.74
 157.8 
 173.1 
 202.7 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  337.3   18.46
 311.2 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  151.5   16.64
 181.9 
 178.5 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  218.7   16.76
 222.4 
 191.7 
 1.02 Seedling (SL08)  251.5   23.3
 218.6 
 1.02 Roots (RT01)  199.1   67.16
 294 
 1.02 Lateral roots (RH01)  422.9   17.58
 396.1 
 429.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  147.5   6.76
 148.8 
 159.8 
 1.05 Rosette (LF11)  154.5   18.17
 190.1 
 178.4 
 1.14 Rosette (LF12)  189.6   43.57
 271.9 
 206.1 
 1.14 Rosette (LF13)  166.8   5.1
 159.6 
 3.20 Whole plant (WP05)  296.9   13.68
 286.2 
 269.8 
 3.70 Adult leaf (LF01)  224.5   8.3
 210.4 
 225.1 
 3.70 Adult leaf (LF02)  218.2   8.4
 208.8 
 201.4 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  253.8   23.85
 259.2 
 215.4 
 3.90 Adult leaf (LF03)  224.6   23.18
 265 
 264.5 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  173.5   10.87
 195 
 187.1 
 3.90 Rosette (SH01)  221.1   9.45
 217.6 
 203.3 
 3.90 Roots (RT04)  280.9   29.02
 329.7 
 332.5 
 3.90 Roots (RT05)  311.2   13.2
 285.1 
 301.7 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  179.4   6.76
 187.2 
 176.2 
 171.1 
 5.10 Flower, buds (FB01)  227.4   25.39
 191.5 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  204.6   11.62
 214.4 
 191.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  177.7   8.49
 194.7 
 185.3 
 5.10 Roots (RT02)  289.1   21.75
 258.3 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  338.8   35.22
 289 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  273.6   45.4
 209.4 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  320.8   19.76
 292.9 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  326.5   26.74
 288.7 
 6.00 Leaf (LF08)  277.9   19.49
 240 
 251.1 
 6.00 Leaf (LF16)  240.5   8.19
 230.4 
 224.2 
 6.00 Inflorescence (IN01)  179.3   17.04
 155.2 
 6.10 Leaf (LF10)  171   24.81
 215.9 
 211.6 
 6.10 Stem base (ST01)  572.6   4.11
 566.8 
 6.10 Stem top (ST02)  173.9   10.81
 189.2 
 6.10 Flower, open (FL01)  476   205.27
 766.3 
 6.30 Silique, young (FS01)  206.6   20.04
 235 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  332.8   40.12
 278.8 
 357.2 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  498.7   69.32
 364.2 
 402.4 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  281.4   3.88
 273.7 
 278.1 
 Suspension cell culture (SU01)  395.4   154.31
 683.4 
 635.3 
 Suspension cell culture (SU02)  586.7   120.78
 415.9 
 Xylem (XL01)  435.4   26.25
 452.1 
 486.9 
 Cork (CR01)  351.8   15.3
 324.2 
 349.4 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  244.1   45.14
 247.3 
 167.5 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  285.2   8.24
 290.2 
 301.3 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  379.8   68.26
 276 
 251.2 
 Heart embryo, roots (EHR1)  174.2   45.25
 130.5 
 221 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  128.2   37.57
 201.8 
 151.6 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  127.5   107.49
 324 
 150.1 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  272.2   77.29
 224.8 
 375.9 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  374.7   84.01
 225.1 
 233.7 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  588   160.46
 275.6 
 368.2 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress