TIGR
MPSS
TAIR
MIPS
 
 

AGI number: At2g25940
TIGR annotation:vacuolar processing enzyme alpha / alpha-VPE
Data resource: NASCArrays
Normalisation: MAS5

 
  Present call   Marginal call   Absent call   None call (Affymetrix)
       
Experiment Relative expression value St. dev.
 0.10 Seed, mature (SM01)  76.3   20.71
 100 
 117.6 
 0.10 Seed, primary dormant imbibed (SDI1)  139.6   20.94
 180.7 
 142.2 
 135.6 
 0.10 Seed, primary dormant (SDP1)  134.8   10.44
 120 
 110.4 
 115.8 
 0.10 Seed, non-dormant (SND1)  107.4   16.26
 100.2 
 70.6 
 86.2 
 0.70 Seedling (SL01)  159.8   7.5
 155.4 
 170 
 0.70 Seedling (SL02)  107.3   4.88
 108.7 
 116.3 
 0.70 Seedling (SL10)  159.4   19.87
 122.4 
 153.6 
 0.70 Seedling (SL12)  195.6   19.27
 186.4 
 158.5 
 0.70 Hypocotyl (HP01)  108.7   6.72
 96.8 
 97.2 
 0.70 Hypocotyl (HP02)  90.2   2.92
 86.3 
 84.5 
 1.00 Seedling (SL07)  125.4   4.42
 131.7 
 1.00 Seedling (SL09)  183.5   27.35
 207.1 
 238 
 1.00 Seedling (SL11)  116.8   20.38
 119.5 
 161.3 
 130.8 
 1.00 Hypocotyl (HP03)  102.2   5.62
 110.1 
 1.00 Seedling, whole plant (WP04)  94.2   5.86
 101.3 
 105.9 
 1.00 Cotyledons and Hypocotyl together (SH02)  94.7   3.97
 89.3 
 87 
 1.02 Seedling (SL08)  140.6   4.51
 134.2 
 1.02 Roots (RT01)  203.3   1.59
 201.1 
 1.02 Lateral roots (RH01)  167.9   3.46
 163.1 
 161.2 
 1.03 Seedling, whole plant (WP02)  129.3   15.96
 105.1 
 99.2 
 1.05 Rosette (LF11)  73.6   17.63
 108.8 
 88.7 
 1.14 Rosette (LF12)  97.6   12.6
 97.5 
 75.7 
 1.14 Rosette (LF13)  70.9   4.18
 76.8 
 3.20 Whole plant (WP05)  134   15.79
 115.8 
 147.2 
 3.70 Adult leaf (LF01)  73.2   9.24
 87.1 
 90.6 
 3.70 Adult leaf (LF02)  88   1.51
 89.6 
 91 
 3.90 Leaf, petiole (PT01)  77.3   3.82
 70.2 
 71.3 
 3.90 Adult leaf (LF03)  77.9   5.23
 81.6 
 88.2 
 3.90 Guard cell-enriched leaf extract (GC01)  97.7   8.36
 84.8 
 100.4 
 3.90 Rosette (SH01)  80.9   13.2
 91.8 
 107.2 
 3.90 Roots (RT04)  146.1   20.89
 175 
 186.6 
 3.90 Roots (RT05)  165.2   24.52
 199.4 
 212.8 
 3.90 Juvenile leaf (LF14)  88.6   3.66
 81 
 80.8 
 83.8 
 5.10 Flower, buds (FB01)  71.8   13.93
 52.1 
 5.10 Flower, young buds (BY01)  73.7   1.52
 70.8 
 71.3 
 5.10 Flower, old buds (BO01)  68.3   5.22
 78.2 
 76.3 
 5.10 Roots (RT02)  160.1   19.23
 132.9 
 5.10 Pollen grain, microspore (MS01)  91.3   3.72
 86 
 5.10 Pollen grain, 2-cellular (BC01)  75.7   9.49
 89.1 
 5.10 Pollen grain, 3-cellular (TC01)  104.1   22.33
 135.7 
 5.10 Pollen grain, mature (MP01)  222.4   34.43
 173.7 
 6.00 Leaf (LF08)  122.2   22.44
 97.9 
 77.4 
 6.00 Leaf (LF16)  106.8   9.98
 89.5 
 89.5 
 6.00 Inflorescence (IN01)  131.1   29.04
 90 
 6.10 Leaf (LF10)  95.1   15.86
 63.6 
 82.8 
 6.10 Stem base (ST01)  124.8   5.72
 116.8 
 6.10 Stem top (ST02)  71.9   4.14
 66 
 6.10 Flower, open (FL01)  109.1   14.88
 88 
 6.30 Silique, young (FS01)  77.9   2.73
 81.8 
 6.90 Silique, mature green (SQ01)  210.3   65.25
 204.9 
 94.7 
 6.90 Seed, fresh (SF01)  133.9   18.15
 124.2 
 98.8 
 8.00 Silique, senescing pod tissue (SP01)  282.9   88
 127.9 
 133.3 
 Suspension cell culture (SU01)  144.1   28.03
 93.3 
 98.2 
 Suspension cell culture (SU02)  91.7   21.33
 121.8 
 Xylem (XL01)  106.4   5.06
 96.3 
 101.2 
 Cork (CR01)  109.4   6.74
 97.5 
 98 
 Globular embryo, apical cells (EGA1)  260.3   65.67
 192.4 
 323.7 
 Globular embryo, basal cells (EGB1)  253.5   35.33
 288.5 
 324.2 
 Heart embryo, cotyledons (EHC1)  195   71.13
 175.4 
 307.3 
 Heart embryo, roots (EHR1)  195.7   1053.38
 2058 
 273.7 
 Torpedo embryo, apical cells (ETA1)  181.6   117.19
 160.1 
 373 
 Torpedo embryo, basal cells (ETB1)  152.8   111.65
 356.8 
 176.2 
 Torpedo embryo, cotyledons (ETC1)  243.5   113.83
 468.8 
 328 
 Torpedo embryo, meristem (ETM1)  495.5   154.63
 500.9 
 230.4 
 Torpedo embryo, roots (ETR1)  204.3   19.34
 198.6 
 168.3 
Normalisation: MAS5
change to: MAS4
Data resource: NASCArrays
     change to: AtGenExpress